Конформациона промена протеина
Конформациона промена протеина је промена облика молекула. Протеини су флексибилни макромолекули. Просторни облици молекула се називају конформације, а прелаз између њих је конформациона промена. Макромолекулска конформациона промена може бити узрокована многим факторима као што су промена температуре, pH, напона, јонске концентрације, или везивањем лиганда.[1]
Садржај |
Експерименталне технике [уреди]
Многе биофизичке технике као што су кристалографија, НМР, и ФРЕТ[2] се могу користити да се студирају макромолекуларне конформационе промене. Дуална поларизациона интерферометрија је екпериментална техника која омогућава мерење конформационих промена молекула у стварном времену у веома високој резолуцији.
Специфична нелинеарна оптичка техника која се назива секундарно-хармоничко генерисање (SHG) је недавно била примењена на студирање конформационих промена протеина. У овом методу, секундарни-хармоник-активна сонда је стављена на место у коме долази до кретања у протеину мутагенезом, или везивањем које није специфично за локацију. Протеин је апсорбован или специфично имобилисан на површини. Промена у протеинској конформацији производи промену у нето оријентацији релативно на површинску раван, и стога промену интензитета другог хармоника. У протеинском узорку са добро дефинисаном оријентацијом, угао нагиба сонде се може квантитативно одредити, у реалном простору и времену. Други-хармоник-активне неприродне аминокиселине се такође могу користити као сонде.[3]
Види још [уреди]
Литература [уреди]
- ^ Hans Frauenfelder (1989). „New looks at protein motions“. Nature 338: 623-624. DOI:10.1038/338623a0.
- ^ Daisuke Kajihara, Ryoji Abe, Issei Iijima, Chie Komiyama, Masahiko Sisido, Takahiro Hohsaka (2006). FRET analysis of protein conformational change through position-specific incorporation of fluorescent amino acids. 3. Nature. стр. 923-929. DOI:10.1038/nmeth945.
- ^ „Detection of Protein Conformational Change by Optical Second-Harmonic Generation“. J. Chem. Phys. 125 (7). 2006. DOI:10.1063/1.2218846.
