ПАС домен
| ПАС савијање | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 Структура ПАС домена бактеријског сензора кисеоника fixL.[1] Протеин је приказан у тракастој нотацији у бојама дуге (Н-терминус = плаво, C-терминус = црвено. Хем лиганд је у средини (угљеник = бело, азот = плаво, кисеоник = црвено, гвожђе = нараџасто). | |||||||||
| Идентификатори | |||||||||
| Симбол | ПАС | ||||||||
| Пфам | ПФ00989 | ||||||||
| ИнтерПро | ИПР013767 | ||||||||
| СМАРТ | ПАС | ||||||||
| ПРОСИТЕ | ПДОЦ50112 | ||||||||
| СЦОП | 2пхy | ||||||||
| СУПЕРФАМИЛY | 2пхy | ||||||||
| |||||||||
ПАС домен је протеински домен који је садржан у многим сигналним протеинима где функционише као сензор сигнална.[2][3] ПАС домени су присутни у великом броју организама од бактерија до људи. ПАС домен је именован користећи почетна слова три протеина:
- Per – Протеин циркадијанског периода
- Arnt – Нуклеарни транспортер арилног угљоводоничног рецептора
- Sim – SIM1
Многи протеини са ПАС доменом детектују сигнал путем асоцијације са кофактором, као што је хем.[4] Протеини који садрже ПАС домен обухватају индуктивне факторе хипоксије.
Референце[уреди | уреди извор]
- ^ PDB: 1y28; Dunham CM, Dioum EM, Tuckerman JR, Gonzalez G, Scott WG, Gilles-Gonzalez MA (2003). „A distal arginine in oxygen-sensing heme-PAS domains is essential to ligand binding, signal transduction, and structure”. Biochemistry. 42 (25): 7701—8. PMID 12820879. doi:10.1021/bi0343370.
- ^ Ponting CP, Aravind L (1997). „PAS: a multi-functional domain family comes to light”. Curr. Biol. 7 (11): R674—7. PMID 9382818. doi:10.1016/S0960-9822(06)00352-6.
- ^ Hefti MH, Françoijs KJ, de Vries SC, Dixon R, Vervoort J (2004). „The PAS fold. A redefinition of the PAS domain based upon structural prediction”. Eur. J. Biochem. 271 (6): 1198—208. PMID 15009198. doi:10.1111/j.1432-1033.2004.04023.x.
- ^ Gilles-Gonzalez MA, Gonzalez G (2004). „Signal transduction by heme-containing PAS-domain proteins”. J. Appl. Physiol. 96 (2): 774—83. PMID 14715687. doi:10.1152/japplphysiol.00941.2003.