LIG4

Из Википедије, слободне енциклопедије
Ligaza IV, DNK, ATP-zavisna

PDB prikaz baziran na 1ik9.
Dostupne strukture
1IK9, 2E2W, 3II6
Identifikatori
Simbol LIG4
Vanjski ID OMIM601837 MGI1335098 HomoloGene1736 GeneCards: LIG4 Gene
EC broj 6.5.1.1
Pregled RNK izražavanja
PBB GE LIG4 206235 at tn.png
podaci
Ortolozi
Vrsta Čovek Miš
Entrez 3981 319583
Ensembl ENSG00000174405 ENSMUSG00000049717
UniProt P49917 Q8BTF5
RefSeq (mRNA) NM_001098268.1 NM_176953.3
RefSeq (protein) NP_001091738.1 NP_795927.2
Lokacija (UCSC) Chr 13:
108.86 - 108.87 Mb
Chr 8:
9.97 - 9.98 Mb
PubMed pretraga [1] [2]

LIG4 je gen koji kodira proteinsku DNK ligazu IV.[1] Ovaj protein je ATP zavisna DNK ligaza koja spaja dvolančane prekide tokom nehomolognog spajanja krajeva u putu popravke prekida dvostrukog lanca. On je takođe esencijalan za V(D)J rekombinaciju.

Defekti ovog gena uzrokuju LIG4 sindrom. Lig4 homolog u kvascu je Dnl4.

Interakcije[уреди]

Lig4 formira kompleks sa XRCC4,[2][3] i dalje interaguje sa DNK zavisnom proteinskom kinazom (DNA-PK) i XLF/Cernunnos.

Reference[уреди]

  1. ^ „Entrez Gene: LIG4 ligase IV, DNA, ATP-dependent“. 
  2. ^ Deshpande Rajashree A, Wilson Thomas E (Oct. 2007). „Modes of interaction among yeast Nej1, Lif1 and Dnl4 proteins and comparison to human XLF, XRCC4 and Lig4“. DNA Repair (Amst.) (Netherlands) 6 (10): 1507–16. DOI:10.1016/j.dnarep.2007.04.014. ISSN 1568-7864. PMC 2064958. PMID 17567543. 
  3. ^ Sibanda B L, Critchlow S E, Begun J, Pei X Y, Jackson S P, Blundell T L, Pellegrini L (Dec. 2001). „Crystal structure of an Xrcc4-DNA ligase IV complex“. Nat. Struct. Biol. (United States) 8 (12): 1015–9. DOI:10.1038/nsb725. ISSN 1072-8368. PMID 11702069. 

Literatura[уреди]

Vidi još[уреди]

Spoljašnje veze[уреди]