Strukturna klasifikacija proteina — разлика између измена

С Википедије, слободне енциклопедије
Интерактиван преглед историје
← Старија изменаНовија измена →
Садржај обрисан Садржај додат
ВизуелноВикитекст
м Бот: Селим 3 међујезичких веза, које су сад на Википодацима на d:q4832556
м →‎top: . using AWB
Ред 1: Ред 1:
'''Strukturna klasifikacija proteina''', {{jez-eng-lat|Structural Classification of Proteins}} (-{SCOP}-), je baza podataka koja prvenstveno sadrži manualnu klasifikacija proteinskih [[strukturni domen|strukturnih domena]]. Ona je bazirana na sličnosti njihovih [[aminokiselina|aminokiselinskih]] [[proteinska sekvenca|sekvenci]] i tri-dimenzionih [[proteinska struktura|struktura]]. Originalno je objavljena [[1995]].<ref name="pmid7723011">{{cite journal | author = Murzin AG, Brenner SE, Hubbard T, Chothia C | title = SCOP: a structural classification of proteins database for the investigation of sequences and structures | journal = J. Mol. Biol. | volume = 247 | issue = 4 | pages = 536–40 | year = 1995 | pmid = 7723011 | doi = 10.1006/jmbi.1995.0159 }}</ref> i obično se ažurira jednom godišnje. Održavaju je Alexej Murzin i njegove kolege,<ref name="pmid11752311">{{cite journal | author = Lo Conte L, Brenner SE, Hubbard TJ, Chothia C, Murzin AG | title = SCOP database in 2002: refinements accommodate structural genomics | journal = Nucleic Acids Res. | volume = 30 | issue = 1 | pages = 264–7 | year = 2002 | pmid = 11752311 | doi = 10.1093/nar/30.1.264 | pmc = 99154 }}</ref><ref name="pmid14681400">{{cite journal | author = Andreeva A, Howorth D, Brenner SE, Hubbard TJ, Chothia C, Murzin AG | title = SCOP database in 2004: refinements integrate structure and sequence family data | journal = Nucleic Acids Res. | volume = 32 | issue = Database issue | pages = D226–9 | year = 2004 | pmid = 14681400 | doi = 10.1093/nar/gkh039 | pmc = 308773 }}</ref>.
'''Strukturna klasifikacija proteina''', {{jez-eng-lat|Structural Classification of Proteins}} (-{SCOP}-), je baza podataka koja prvenstveno sadrži manualnu klasifikacija proteinskih [[strukturni domen|strukturnih domena]]. Ona je bazirana na sličnosti njihovih [[aminokiselina|aminokiselinskih]] [[proteinska sekvenca|sekvenci]] i tri-dimenzionih [[proteinska struktura|struktura]]. Originalno je objavljena [[1995]].<ref name="pmid7723011">{{cite journal |vauthors=Murzin AG, Brenner SE, Hubbard T, Chothia C | title = SCOP: a structural classification of proteins database for the investigation of sequences and structures | journal = J. Mol. Biol. | volume = 247 | issue = 4 | pages = 536–40 | year = 1995 | pmid = 7723011 | doi = 10.1006/jmbi.1995.0159 }}</ref> i obično se ažurira jednom godišnje. Održavaju je Alexej Murzin i njegove kolege,<ref name="pmid11752311">{{cite journal |vauthors=Lo Conte L, Brenner SE, Hubbard TJ, Chothia C, Murzin AG | title = SCOP database in 2002: refinements accommodate structural genomics | journal = Nucleic Acids Res. | volume = 30 | issue = 1 | pages = 264–7 | year = 2002 | pmid = 11752311 | doi = 10.1093/nar/30.1.264 | pmc = 99154 }}</ref><ref name="pmid14681400">{{cite journal |vauthors=Andreeva A, Howorth D, Brenner SE, Hubbard TJ, Chothia C, Murzin AG | title = SCOP database in 2004: refinements integrate structure and sequence family data | journal = Nucleic Acids Res. | volume = 32 | issue = Database issue | pages = D226–9 | year = 2004 | pmid = 14681400 | doi = 10.1093/nar/gkh039 | pmc = 308773 }}</ref>.


==Hijerarhijska struktura==
==Hijerarhijska struktura==

Верзија на датум 24. октобар 2016. у 04:57

Strukturna klasifikacija proteina, engl. Structural Classification of Proteins (SCOP), je baza podataka koja prvenstveno sadrži manualnu klasifikacija proteinskih strukturnih domena. Ona je bazirana na sličnosti njihovih aminokiselinskih sekvenci i tri-dimenzionih struktura. Originalno je objavljena 1995.[1] i obično se ažurira jednom godišnje. Održavaju je Alexej Murzin i njegove kolege,[2][3].

Hijerarhijska struktura

SCOP sadrži četiri nivoa hijerarhijske strukturne klasifikacije:

  • klasa - generalna "strukturna arhitektura" domena
  • nabor - slična organizacija regularne sekundarne strukture ali bez evidencije o evolucionoj povezanosti
  • superfamilija - dovoljna strukturna i funkciona sličnost da se izvede zaključak o divergentnoj evolucijskoj vezi, mada homologija sekvenci ne postoji
  • familija - sličnost sekvenci se može detektovati

Vidi još

Literatura

  1. ^ Murzin AG, Brenner SE, Hubbard T, Chothia C (1995). „SCOP: a structural classification of proteins database for the investigation of sequences and structures”. J. Mol. Biol. 247 (4): 536—40. PMID 7723011. doi:10.1006/jmbi.1995.0159. 
  2. ^ Lo Conte L, Brenner SE, Hubbard TJ, Chothia C, Murzin AG (2002). „SCOP database in 2002: refinements accommodate structural genomics”. Nucleic Acids Res. 30 (1): 264—7. PMC 99154 Слободан приступ. PMID 11752311. doi:10.1093/nar/30.1.264. 
  3. ^ Andreeva A, Howorth D, Brenner SE, Hubbard TJ, Chothia C, Murzin AG (2004). „SCOP database in 2004: refinements integrate structure and sequence family data”. Nucleic Acids Res. 32 (Database issue): D226—9. PMC 308773 Слободан приступ. PMID 14681400. doi:10.1093/nar/gkh039. 

Spoljašnje veze

Преузето из „https://sr.wikipedia.org/w/index.php?title=Strukturna_klasifikacija_proteina&oldid=12151929”