Cisteinska peptidaza

Из Википедије, слободне енциклопедије
(преусмерено са Cisteinska proteaza)
Jump to navigation Jump to search
Cisteinska peptidaza
Papain enzyme.png
Kristalna struktura cisteinske peptidaze papainskog kompleksa sa kovalentnim inhibitorom E-64.
Identifikatori
Simbol Peptidase_C1
Pfam PF00112
Pfam klan CL0125
InterPro IPR000668
SMART SM00645
PROSITE PDOC00126
MEROPS C1
SCOP 1aec
Superfamilija 1aec
OPM protein 420
OPM protein 1m6d

Cisteinske proteaze – poznate i kao tiolske proteaze – su enzimi koji degradiraju proteine. Ove proteaze imaju zajedničke katalitičke mehanizme koji uključuju nukleofilni cisteinski tiol u katalitičkoj trijadi ili dijadi.

Cisteinske proteaze su generalno nalaze u voću, uključujući papaju, ananas smokvu i kivi. Proporcija proteaza je veća u nezrelom voću. Ustvari, poznato je nekoliko porodica čiji predstavnici sadrže cisteinske proteaze.[1] Cisteinske proteaze se upotrebljavaju kao ingredijenti – sastojci za učvršćivanje mesa.[2][3][4][5][6]

Klasifikacija[уреди]

MEROPS sistem klasifikacije proteaza uračunava 14 proteinskih superfamilija plus nekoliko neoznačenih (do 2013.), a svaka sadrži mnogo familija. Svaka superporodica ima katalitičku trijadu ili dijadu u različitim proteinskim naborima i tako ukazuju na konvergentnu evoluciju katalitičkog mehanizma.

Za proteinske superfamilije, P = superfamilija koja sadrži mešavinu nukleofilnih klasa familija, C = čista cisteinska proteazna superfamilija. U svakoj superfamiliji, proteinske familije su označene karakterističnim nukleofilom (C = cisteinske proteaze).

Familije cisteinskih proteaza

Supefamilija Familija Primeri
CA C1, C2, C6, C10, C12, C16, C19, C28, C31, C32, C33, C39, C47, C51, C54, C58, C64,

C65, C66, C67, C70, C71, C76, C78, C83, C85, C86, C87, C93, C96, C98, C101

Papain (Carica papaya),[7] bromelain (Ananas comosus), katepsin K (metilj)[8] i kalpain (Homo sapiens)[9]
CD C11, C13, C14, C25, C50, C80, C84 Kaspaza-1 (Rattus norvegicus) i separaza (Saccharomyces cerevisiae)
CE C5, C48, C55, C57, C63, C79 Adenain (ljudski adenovirus tip 2)
CF C15 Piroglutamil-peptidaza I (Bacillus amyloliquefaciens)
CL C60, C82 Sortaza A (Staphylococcus aureus)
CM C18 Hepatitis C virus peptidaza 2 (Hepatitis C virus)
CN C9 Sindbis virus-tipe nsP2 peptidaza (sindbis virus)
CO C40 Dipeptidil-peptidaza VI (Lysinibacillus sphaericus)
CP C97 DeSI-1 peptidaza (Mus musculus)
PA C3, C4, C24, C30, C37, C62, C74, C99 TEV proteaza ( Etch virus duhana)
PB C44, C45, C59, C69, C89, C95 Prekursor amidofosforiboziltransferaze (Homo sapiens)
PC C26, C56 Gama-glutamil hidrolaza (Rattus norvegicus)
PD C46 Ježni protein (Drosophila melanogaster)
PE P1 DmpA aminopeptidaza (Ochrobactrum anthropi)
Neoznačeni C7, C8, C21, C23, C27, C36, C42, C53, C75

Reference[уреди]

  1. ^ Domsalla A, Melzig MF (2008). „Occurrence and properties of proteases in plant latices”. Planta Med. 74 (7): 699—711. PMID 18496785. doi:10.1055/s-2008-1074530. 
  2. ^ Bajrović K, Jevrić-Čaušević A., Hadžiselimović R., Ed. (2005): Uvod u genetičko inženjerstvo i biotehnologiju. Institut za genetičko inženjerstvo i biotehnologiju (INGEB), Sarajevo, ISBN 9958-9344-1-8.
  3. ^ Ibrulj S., Haverić S., Haverić A. (2008): Citogenetičke metode – Primjena u medicini . Institut za genetičko inženjerstvo i biotehnologiju (INGEB), Sarajevo,ISBN 978-9958-9344-5-2.
  4. ^ Hadžiselimović R., Pojskić N. (2005): Uvod u humanu imunogenetiku. Institut za genetičko inženjerstvo i biotehnologiju (INGEB), Sarajevo, ISBN 9958-9344-3-4.
  5. ^ Sofradžija A., Šoljan D., Hadžiselimović R. (2000): Biologija 1, Svjetlost, Sarajevo
  6. ^ Međedović S., Maslić E., Hadžiselimović R. (2000): Biologija 2. Svjetlost, Sarajevo, ISBN 9958-10-222-6.
  7. ^ Mitchel, R. E.; Chaiken, I. M.; Smith, E. L. (1970). „The complete amino acid sequence of papain. Additions and corrections”. The Journal of Biological Chemistry. 245 (14): 3485—92. PMID 5470818. 
  8. ^ Sierocka, I; Kozlowski, L. P.; Bujnicki, J. M.; Jarmolowski, A; Szweykowska-Kulinska, Z (2014). „Female-specific gene expression in dioecious liverwort Pellia endiviifolia is developmentally regulated and connected to archegonia production”. BMC Plant Biology. 14: 168. PMC 4074843Слободан приступ. PMID 24939387. doi:10.1186/1471-2229-14-168. 
  9. ^ Sorimachi, H; Ohmi, S; Emori, Y; Kawasaki, H; Saido, T. C.; Ohno, S; Minami, Y; Suzuki, K (1990). „A novel member of the calcium-dependent cysteine protease family”. Biological chemistry Hoppe-Seyler. 371 Suppl: 171—6. PMID 2400579. 

Spoljašnje veze[уреди]