Алфа соленоид

Илустрација алфа соленоидног савијања у тримеру протеина који садржи перидинин-хлорофил из динофлагелате Amphidinium carterae. Везани перидинински пигменти су приказани љубичасто, а хлорофил црно.

Алфа соленоид је протеинско савијање присутно у протеинским подјединицама комплекса сабирања светлости, посебно у перидинин хлорофилним протеинима динофлагелата, и у доменима већих еукариотских протеина који сачињавају комплекс пора једра. Мотив се састоји од алфа хеликса који образују закривљену шему, која подсећа на савијање бета барела. Мера алфа соленоидне закривљености зависи од примарне секвенце. Јако закривљени соленоиди имају предвидиве секвентне шеме, што је било корисно у идентификацији могућих соленоиду сличних компоненти у протеазому.

Литература

• Hofmann E, Wrench PM, Sharples FP, Hiller RG, Welte W, Diederichs K. (1996). Structural basis of light harvesting by carotenoids: peridinin-chlorophyll-protein from Amphidinium carterae. Science 272(5269):1788-91.
• Devos D, Dokudovskaya S, Alber F, Williams R, Chait BT, Sali A, Rout MP. (2004). Components of coated vesicles and nuclear pore complexes share a common molecular architecture. PLoS Biol 2(12):e380.
• Kajava AV. (2002). What curves alpha-solenoids? Evidence for an alpha-helical toroid structure of Rpn1 and Rpn2 proteins of the 26 S proteasome. J Biol Chem 277(51):49791-8.

Спољашње везе

• CATH alpha solenoid architecture