Конформациона промена протеина

Конформациона промена протеина је промена облика молекула. Протеини су флексибилни макромолекули. Просторни облици молекула се називају конформације, а прелаз између њих је конформациона промена. Макромолекулска конформациона промена може бити узрокована многим факторима као што су промена температуре, pH, напона, јонске концентрације, или везивањем лиганда.

Експерименталне технике

Многе биофизичке технике као што су кристалографија, НМР, и ФРЕТ се могу користити да се студирају макромолекуларне конформационе промене. Дуална поларизациона интерферометрија је експериментална техника која омогућава мерење конформационих промена молекула у стварном времену у веома високој резолуцији.

Специфична нелинеарна оптичка техника која се назива секундарно-хармоничко генерисање (SHG) је недавно била примењена на студирање конформационих промена протеина. У овом методу, секундарни-хармоник-активна сонда је стављена на место у коме долази до кретања у протеину мутагенезом, или везивањем које није специфично за локацију. Протеин је апсорбован или специфично имобилисан на површини. Промена у протеинској конформацији производи промену у нето оријентацији релативно на површинску раван, и стога промену интензитета другог хармоника. У протеинском узорку са добро дефинисаном оријентацијом, угао нагиба сонде се може квантитативно одредити, у реалном простору и времену. Други-хармоник-активне неприродне аминокиселине се такође могу користити као сонде.

Види још

• База података макромолекулског кретања (молмовдб)
• Протеинска динамика

Литература

• Даисуке Кајихара; Рyоји Абе; Иссеи Иијима; Цхие Комиyама; Масахико Сисидо; Такахиро Хохсака (2006). ФРЕТ аналyсис оф протеин цонформатионал цханге тхроугх поситион-специфиц инцорпоратион оф флуоресцент амино ацидс. Натуре Метходс. 3. Натуре. стр. 923—929. дои:10.1038/нметх945. 

Спољашње везе

• Биодесy