ПДЗ домен
 Молекулска структура PDZ домена укључујући људски GOPC (Голџи-везани PDZ протеин који садржи мотив упредене завојнице) | |||||||||
| Идентификатори | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Симбол | ПДЗ | ||||||||
| Пфам | ПФ00595 | ||||||||
| ИнтерПро | ИПР001478 | ||||||||
| СМАРТ | ПДЗ | ||||||||
| ПРОСИТЕ | ПДОЦ50106 | ||||||||
| СЦОП | 1лцy | ||||||||
| СУПЕРФАМИЛY | 1лцy | ||||||||
| |||||||||
PDZ домен је заједнички структурни домен са 80-90 аминокиселина који је нађен код сигналних протеина бактерија, квасца, биљки, вируса[1] и животиња.[2] PDZ је акроним формиран комбиновањем првих слова имена три протеина — ПСД95 (енгл. post synaptic density protein), ДлгА (енгл. Drosophila disc large tumor suppressor), и зо-1 (енгл. zonula occludens-1 protein) — за које су прво откривено да имају заједнички домен. ПДЗ домени су се раније називали DHR (Dlg хомологним регионом)[3] или GLGF (глицин-леуцин-глицин-фенилаланин) доменима. Ти домени помажу везивање трансмембранских протеина за цитоскелет и држе на окупу сигналне комплексе[4].
PDZ домени имају способност везивања за кратки регион C-терминуса других специфичних протеина. Ти кратки региони се везују за PDZ домен путем аугментације бета равни. Бета раван PDZ домена се увећава додатком додатног бета ланаца из везаног протеина.[5]
Протеини који садрже овај домен[уреди | уреди извор]
ПДЗ домени су нађени код више хиљада познатих протеина[6] Ти протеини су широко распрострањени код еукариота и еубактерија,[7] док има веома мало примера тих протеина код Archaebacteria. ПДЗ домени су често са другим протеинским доменима и те комбинације им омогућавају да извршавају њихове специфичне функције. На пример за PDZ домене у PSD-95 протеинима је утврђено да су везани са SH3 доменом и гуанилат киназним доменом.
Литература[уреди | уреди извор]
- ^ Боxус M, Тwизере ЈЦ, Легрос С, Деwулф ЈФ, Кеттманн Р, Wиллемс L (2008). „Тхе ХТЛВ-1 Таx интерацтоме”. Ретровирологy. 5: 76. ПМЦ 2533353
. ПМИД 18702816. дои:10.1186/1742-4690-5-76.
- ^ Понтинг ЦП (1997). „Евиденце фор ПДЗ домаинс ин бацтериа, yеаст, анд плантс”. Протеин Сци. 6 (2): 464—8. ПМЦ 2143646 . ПМИД 9041651. дои:10.1002/про.5560060225.
- ^ Понтинг ЦП, Пхиллипс C (1995). „ДХР домаинс ин сyнтропхинс, неуронал НО сyнтхасес анд отхер интрацеллулар протеинс”. Трендс Биоцхем. Сци. 20 (3): 102—3. ПМИД 7535955. дои:10.1016/С0968-0004(00)88973-2.
- ^ Ранганатхан Р, Росс Е (1997). „ПДЗ домаин протеинс: сцаффолдс фор сигналинг цомплеxес.”. Цурр Биол. 7 (12): Р770—3. ПМИД 9382826. дои:10.1016/С0960-9822(06)00401-5.
- ^ Цоwбурн D (1997). „Пептиде рецогнитион бy ПТБ анд ПДЗ домаинс”. Цурр. Опин. Струцт. Биол. 7 (6): 835—8. ПМИД 9434904. дои:10.1016/С0959-440X(97)80155-8.
- ^ Лее ХЈ, Зхенг ЈЈ (2010). „ПДЗ домаинс анд тхеир биндинг партнерс: струцтуре, специфицитy, анд модифицатион”. Целл Цоммун. Сигнал. 8: 8. ПМЦ 2891790 . ПМИД 20509869. дои:10.1186/1478-811X-8-8.
- ^ Понтинг ЦП (1997). „Евиденце фор ПДЗ домаинс ин бацтериа, yеаст, анд плантс”. Протеин Сци. 6 (2): 464—8. ПМЦ 2143646 . ПМИД 9041651. дои:10.1002/про.5560060225.
Додатна литература[уреди | уреди извор]
- Понтинг ЦП, Пхиллипс C, Давиес КЕ, Блаке ДЈ (1997). „ПДЗ домаинс: таргетинг сигналлинг молецулес то суб-мембраноус ситес”. Биоессаyс. 19 (6): 469—79. ПМИД 9204764. дои:10.1002/биес.950190606.
- Доyле ДА, Лее А, Леwис Ј, Ким Е, Схенг M, МацКиннон Р (1996). „Црyстал струцтурес оф а цомплеxед анд пептиде-фрее мембране протеин-биндинг домаин: молецулар басис оф пептиде рецогнитион бy ПДЗ”. Целл. 85 (7): 1067—76. ПМИД 8674113. дои:10.1016/С0092-8674(00)81307-0.