Ciklično nukleotidna fosfodiesteraza
| 3'5'-ciklično nukleotidna fosfodiesteraza | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 Ciklično nukleotidna fosfodiesteraza tetramer, Human | |||||||||
| Identifikatori | |||||||||
| Simbol | PDEase_I | ||||||||
| Pfam | PF00233 | ||||||||
| InterPro | IPR002073 | ||||||||
| PROSITE | PDOC00116 | ||||||||
| SCOP | 1f0j | ||||||||
| SUPERFAMILY | 1f0j | ||||||||
| |||||||||
| 3',5'-ciklično-nukleotidna fosfodiesteraza | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Identifikatori | |||||||||
| EC broj | 3.1.4.17 | ||||||||
| CAS broj | 9040-59-9 | ||||||||
| Baze podataka | |||||||||
| IntEnz | IntEnz pregled | ||||||||
| BRENDA | BRENDA pristup | ||||||||
| ExPASy | NiceZyme pregled | ||||||||
| KEGG | KEGG pristup | ||||||||
| MetaCyc | metabolički put | ||||||||
| PRIAM | profil | ||||||||
| Strukture PBP | RCSB PDB PDBe PDBj PDBsum | ||||||||
| Ontologija gena | AmiGO / EGO | ||||||||
| |||||||||
3'5'-ciklično nukleotidna fosfodiesteraza je familija fosfodiesteraza.[1] Ovi enzimi katalizuju sledeće reakcije:
- nukleozid 3',5'-ciklični fosfat + H2O = nukleozid 5'-fosfat
gde je nukleozid 3',5'-ciklični fosfat: 3',5'-ciklični AMP, 3',5'-ciklični dAMP, 3',5'-ciklični IMP, 3',5'-ciklični GMP ili 3',5'-ciklični CMP.
Retinalna 3',5'-cGMP fosfodiesteraza (EC 3.1.4.17) (PDE) je locirana u spoljašnjem segmentu fotoreceptora.[2] Ona je svetlom aktivirana i učestvuje u prenosu signala. U štapićastim ćelijama PDE je oligomerna. Ona se sastoji od alfa-, beta- i 2 gama-podjedinaca, dok je PDE u kupastim ćelijama homodimer alfa lanaca, koji vezan za nekoliko manjih podjedinca. Oba PDE tipa katalizuju hidrolizu cAMP ili cGMP u korespondirajuće nukleozide 5' monofosfate. Oba enzima imaju veći afinitet za cGMP. Mesta cGMP vezivanja su locirana na N-terminalnoj polovini proteinske sekvence, dok se katalitički deo nalazi na C-terminalnom segmentu.
Humani proteini koji sadrže ovaj domen[уреди | уреди извор]
- PDE1A, PDE1B, PDE1B2, PDE1C, PDE2A, PDE3A, PDE3B, PDE4A, PDE4B, PDE4B5, PDE4C, PDE4D,
- PDE5A, PDE6A, PDE6B, PDE6C, PDE7A, PDE7B, PDE8A, PDE8B, PDE9A,
- PDE10A, PDE10A2, PDE11A,
Reference[уреди | уреди извор]
- ^ Donald Voet; Judith G. Voet (2005). Biochemistry (3 изд.). Wiley. ISBN 9780471193500.
- ^ Watson S, Arkinstall S (1994). „Opsins”: 214—222.
Literatura[уреди | уреди извор]
- Nicholas C. Price; Lewis Stevens (1999). Fundamentals of Enzymology: The Cell and Molecular Biology of Catalytic Proteins (Third изд.). USA: Oxford University Press. ISBN 019850229X.
- Eric J. Toone (2006). Advances in Enzymology and Related Areas of Molecular Biology, Protein Evolution (Volume 75 изд.). Wiley-Interscience. ISBN 0471205036.
- Branden C; Tooze J. Introduction to Protein Structure. New York, NY: Garland Publishing. ISBN 0-8153-2305-0.
- Irwin H. Segel. Enzyme Kinetics: Behavior and Analysis of Rapid Equilibrium and Steady-State Enzyme Systems (Book 44 изд.). Wiley Classics Library. ISBN 0471303097.
- William P. Jencks (1987). Catalysis in Chemistry and Enzymology. Dover Publications. ISBN 0486654605.
