База података конзервираних домена
 | |
|---|---|
| Контент | |
| Опис | База података конзервираних домена за функционалну анотацију протеина |
| Контакт | |
| Истраживачки центар | Национални центар за биотехнолошке информације |
| Аутори | Aron Marchler-Bauer |
| Примарни цитат | Marchler-Bauer & al. (2011)[1] |
| Датум објављивања | 2003 |
| Приступ | |
| Веб страница | ncbi.nlm.nih.gov |
| Алати | |
| Разно | |
База података конзервираних домена (ЦДД) је база података документованих модела поравнавања вишеструких секвенци и модела изведених путем претраживања базе, за древне домене и протеине пуне дужине.[1]
Садржај базе података[уреди | уреди извор]
ЦДД садржај обухвата НЦБИ ручно обрађене моделе домена, као и моделе унесене из бројних спољашњих извора (Pfam, SMART, COG, PRK, TIGRFAM). Јединствена карактеристка НЦБИ ревидираних домена је да се користе 3Д-структурне информације да се експлицитно дефинишу границе домена, поравнају блокови, коријугу детаљи поравнавања, и пружи увид у односе секвенце, структуре и функције. Ручно третирани модели су организовани у хијерархију, кад се описују фамилије домена које имају заједничко порекло.
Референце[уреди | уреди извор]
- ^ а б Марцхлер-Бауер А, Лу С, Андерсон ЈБ, Цхитсаз Ф, Дербyсхире МК, ДеWеесе-Сцотт C, Фонг ЈХ, Геер ЛY, Геер РЦ, Гонзалес НР, Гwадз M, Хурwитз DI, Јацксон ЈД, Ке З, Ланцзyцки ЦЈ, Лу Ф, Марцхлер ГХ, Муллокандов M, Омелцхенко MV, Робертсон CL, Сонг ЈС, Тханки Н, Yамасхита РА, Зханг D, Зханг Н, Зхенг C, Брyант СХ (2011). „ЦДД: а Цонсервед Домаин Датабасе фор тхе фунцтионал аннотатион оф протеинс”. Нуцлеиц Ацидс Рес. 39 (Датабасе иссуе): Д225—9. ПМЦ 3013737
. ПМИД 21109532. дои:10.1093/нар/гкq1189.
Спољашње везе[уреди | уреди извор]
- „Цонсервед Домаинс Датабасе (ЦДД) анд Ресоурце Гроуп”. Унитед Статес Натионал Центер фор Биотецхнологy Информатион.