Alternativno splajsovanje — разлика између измена
мНема описа измене |
мНема описа измене |
||
| Ред 6: | Ред 6: | ||
Proizvodnja alternativno splajsovanih iRNK molekula je regulisana sistemom [[trans-delujući]]h proteina koji se vezuju za [[cis-delujući|cis-delujuća]] mesta na samim pre-iRNK molekulima. Takvi proteini obuhvataju splajsne aktivatore koji podstiču upotrebu određenog splajsnog mesta, i splajsne represore koji umanjuju upotrebu pojedinih mesta. Mehanizmi alternativnog splajsovanja su visoko varijabilni, i novi primeri se konstantno nalaze, posebno upotrebom visoko-protočnih tehnika. Istraživači se nadaju da će vremenom regulatorni sistem splajsovanja biti potpuno ispitan, tako da će postati moguće da se predvide proizvodi alternativnog splajsovanja gena pod datim uslovima upotrebom „splajsnog koda“<ref name=Matlin/><ref name=David>{{cite journal | author = David CJ, Manley JL | title = The search for alternative splicing regulators: new approaches offer a path to a splicing code | journal = Genes & Development | volume = 22 | issue = 3 | pages = 279–85 | year = 2008 | month = February | pmid = 18245441 | pmc = 2731647 | doi = 10.1101/gad.1643108 | url = http://www.genesdev.org/cgi/pmidlookup?view=long&pmid=18245441}}</ref>. |
Proizvodnja alternativno splajsovanih iRNK molekula je regulisana sistemom [[trans-delujući]]h proteina koji se vezuju za [[cis-delujući|cis-delujuća]] mesta na samim pre-iRNK molekulima. Takvi proteini obuhvataju splajsne aktivatore koji podstiču upotrebu određenog splajsnog mesta, i splajsne represore koji umanjuju upotrebu pojedinih mesta. Mehanizmi alternativnog splajsovanja su visoko varijabilni, i novi primeri se konstantno nalaze, posebno upotrebom visoko-protočnih tehnika. Istraživači se nadaju da će vremenom regulatorni sistem splajsovanja biti potpuno ispitan, tako da će postati moguće da se predvide proizvodi alternativnog splajsovanja gena pod datim uslovima upotrebom „splajsnog koda“<ref name=Matlin/><ref name=David>{{cite journal | author = David CJ, Manley JL | title = The search for alternative splicing regulators: new approaches offer a path to a splicing code | journal = Genes & Development | volume = 22 | issue = 3 | pages = 279–85 | year = 2008 | month = February | pmid = 18245441 | pmc = 2731647 | doi = 10.1101/gad.1643108 | url = http://www.genesdev.org/cgi/pmidlookup?view=long&pmid=18245441}}</ref>. |
||
Abnormalne varijacije u splajsovanju su implicirane kao uzrok bolesti. Veliki deo ljudskih [[nasledne bolesti|naslednih bolesti]] je posledica neadekvatnih splajsnih varijanti<ref name=Matlin/>. Za abnormalne splajsne varijante se takođe smatra da doprinose razvoju raka<ref name="Skotheim and Nees 2007">{{Cite web | year = 2007 | title = Alternative splicing in cancer: noise, functional, or systematic? | url = http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/17416541 | author = Skotheim and Nees}}</ref><ref name=He2009>{{cite journal | author = He C, Zhou F, Zuo Z, Cheng H, Zhou R | title = A global view of cancer-specific transcript variants by subtractive transcriptome-wide analysis | journal = Plos One | volume = 4 | issue = 3 | pages = e4732 | year = 2009 | pmid = 19266097 | pmc = 2648985 | doi = 10.1371/journal.pone.0004732 | url = http://dx.plos.org/10.1371/journal.pone.0004732}}</ref><ref name=Fackenthal>{{Cite journal | doi = 10.1242/dmm.000331 | year = 2008 | month = Jul | author = Fackenthal, Jd; Godley, La | title = Aberrant RNA splicing and its functional consequences in cancer cells | volume = 1 | issue = 1 | pages = 37–42 | issn = 1754-8403 | pmid = 19048051 | pmc = 2561970 | journal = Disease models & mechanisms | url = http://dmm.biologists.org/cgi/pmidlookup?view=long&pmid=19048051 | format = Free full text }}</ref><ref name="pmid20813049">{{cite journal | author = Valletti A, Anselmo A, Mangiulli M, Boria I, Mignone F, Merla G, D'Angelo V, Tullo A, Sbisà E, D'Erchia AM, Pesole G | title = Identification of tumor-associated cassette exons in human cancer through EST-based computational prediction and experimental validation | journal = Molecular Cancer | volume = 9 | issue = | pages = 230 | year = 2010 | pmid = 20813049 | pmc = 2941758 | doi = 10.1186/1476-4598-9-230 | url = http://www.molecular-cancer.com/content/9//230}}</ref>. |
|||
==Otkriće== |
|||
== Literatura == |
== Literatura == |
||
Верзија на датум 21. децембар 2010. у 06:30
Alternativno splajsovanje (ili diferencijalno splajsovanje) je proces kojim se RNK eksoni proizvedeni transkripcijom gena (primarni genski transkript ili pre-iRNK) ponovno spajaju na više načina tokom RNK splajsovanja. Rezultujući različiti iRNK molekuli mogu biti translirani u različite proteinske izoforme; tim putem jedan gen može da kodira više proteina[1].
Alternativno splajsovanje se javlja kao normalna pojava kod eukariota, gde to znatno povećava raznovrsnost proteina koji mogu biti kodirani genomom[1]. Kod ljudi preko 80% gena su alternativno splajsovani[2]. Brojni modovi alternativnog splajsovanja su uočeni, od kojih najčešći je preskakanje eksona. U tom modu, pojedini ekson može biti uključen u iRNK pod nekim uslovima ili u pojedinim tkivima, i izostavljen iz iRNK u drugim[1].
Proizvodnja alternativno splajsovanih iRNK molekula je regulisana sistemom trans-delujućih proteina koji se vezuju za cis-delujuća mesta na samim pre-iRNK molekulima. Takvi proteini obuhvataju splajsne aktivatore koji podstiču upotrebu određenog splajsnog mesta, i splajsne represore koji umanjuju upotrebu pojedinih mesta. Mehanizmi alternativnog splajsovanja su visoko varijabilni, i novi primeri se konstantno nalaze, posebno upotrebom visoko-protočnih tehnika. Istraživači se nadaju da će vremenom regulatorni sistem splajsovanja biti potpuno ispitan, tako da će postati moguće da se predvide proizvodi alternativnog splajsovanja gena pod datim uslovima upotrebom „splajsnog koda“[2][3].
Abnormalne varijacije u splajsovanju su implicirane kao uzrok bolesti. Veliki deo ljudskih naslednih bolesti je posledica neadekvatnih splajsnih varijanti[2]. Za abnormalne splajsne varijante se takođe smatra da doprinose razvoju raka[4][5][6][7].
Otkriće
Literatura
- ^ а б в Black, Douglas L. (2003). „Mechanisms of alternative pre-messenger RNA splicing”. Annual Reviews of Biochemistry. 72 (1): 291—336. PMID 12626338. doi:10.1146/annurev.biochem.72.121801.161720.
- ^ а б в Matlin, AJ (мај 2005). „Understanding alternative splicing: towards a cellular code”. Nature Reviews. 6 (5): 386—398. PMID 15956978. doi:10.1038/nrm1645. Непознати параметар
|coauthors=игнорисан [|author=се препоручује] (помоћ) - ^ David CJ, Manley JL (2008). „The search for alternative splicing regulators: new approaches offer a path to a splicing code”. Genes & Development. 22 (3): 279—85. PMC 2731647
. PMID 18245441. doi:10.1101/gad.1643108. Непознати параметар |month=игнорисан (помоћ) - ^ Skotheim and Nees (2007). „Alternative splicing in cancer: noise, functional, or systematic?”.
- ^ He C, Zhou F, Zuo Z, Cheng H, Zhou R (2009). „A global view of cancer-specific transcript variants by subtractive transcriptome-wide analysis”. Plos One. 4 (3): e4732. PMC 2648985 . PMID 19266097. doi:10.1371/journal.pone.0004732.
- ^ Fackenthal, Jd; Godley, La (2008). „Aberrant RNA splicing and its functional consequences in cancer cells” (Free full text). Disease models & mechanisms. 1 (1): 37—42. ISSN 1754-8403. PMC 2561970 . PMID 19048051. doi:10.1242/dmm.000331. Непознати параметар
|month=игнорисан (помоћ) - ^ Valletti A, Anselmo A, Mangiulli M, Boria I, Mignone F, Merla G, D'Angelo V, Tullo A, Sbisà E, D'Erchia AM, Pesole G (2010). „Identification of tumor-associated cassette exons in human cancer through EST-based computational prediction and experimental validation”. Molecular Cancer. 9: 230. PMC 2941758 . PMID 20813049. doi:10.1186/1476-4598-9-230.
