База података транспортерске класификације

База података транспортерске класификације (енгл. Transporter Classification database, ТЦДБ) је класификациони систем који је одобрила Међународна унија за биохемију и молекуларну биологију (IUBMB) за мембранске транспортне протеине укључујући јонске канале.^[1] Овај класификациони систем је дизајниран да буде аналоган са системом ЕЦ бројева за класификацију ензима, мада он такође користи филогенетичке информације.

Референце[уреди | уреди извор]

^ Саиер МХ, Yен МР, Ното К, Таманг ДГ, Елкан C (2009). „Тхе Транспортер Цлассифицатион Датабасе: рецент адванцес”. Нуцлеиц Ацидс Рес. 37 (Датабасе иссуе): Д274—8. ПМЦ 2686586 . ПМИД 19022853. дои:10.1093/нар/гкн862.

Саиер МХ, Тран CV, Баработе РД (2006). „ТЦДБ: тхе Транспортер Цлассифицатион Датабасе фор мембране транспорт протеин аналyсес анд информатион”. Нуцлеиц Ацидс Рес. 34 (Датабасе иссуе): Д181—6. ПМЦ 1334385 . ПМИД 16381841. дои:10.1093/нар/гкј001.
Бусцх W, Саиер МХ (2002). „Тхе транспортер цлассифицатион (ТЦ) сyстем, 2002”. Црит. Рев. Биоцхем. Мол. Биол. 37 (5): 287—337. ПМИД 12449427. дои:10.1080/10409230290771528.

L-тип/Ca_vα (1.1, 1.2, 1.3, 1.4) · N-тип/Ca_vα2.2 · P-тип/Ca_vα(2.1) · Q-тип/Ca_vα2.1 · R-тип/Ca_vα2.3 · Т-тип/Ca_vα(3.1, 3.2, 3.3)
α₂δ-подјединица (1, 2) · β-подјединица (β1, β2, β3, β4) · γ-подјединица (γ1, γ2, γ3, γ4)
Катјонски канали сперме (1, 2, 3, 4) · Двопорни канал (1, 2)

Лигандом контролисани

Напоном-контролисани	Na_vα (1.1, 1.2, 1.3, 1.4, 1.5, 1.6, 1.7, 1.8, 1.9, 7А) · Na_vβ (1, 2, 3, 4)
Конститутивно активни	Епителни натријумски канал (α, β, γ, δ)

Напоном-контролисани	K_vα1-6 (1.1, 1.2, 1.3, 1.4, 1.5, 1.6, 1.7, 1.8) · (2.1, 2.2) · (3.1, 3.2, 3.3, 3.4) · (4.1, 4.2, 4.3) · (5.1) · (6.1, 6.2, 6.3, 6.4) K_vα7-12 (7.1, 7.2, 7.3, 7.4, 7.5) · (8.1, 8.2) · (9.1, 9.2, 9.3) · (10.1, 10.2) · (11.1/hERG, 11.2, 11.3) · (12.1, 12.2, 12.3) K_vβ (1, 2, 3) · KCNIP (1, 2, 3, 4) · minK/ISK · minK/ISK-сличан · MiRP (1, 2, 3) · Shaker ген
Калцијумом-активирани	БК канал (α1, β1, β2, β3, β4) · SK канал (SK1, SK2, SK3, SK4) · K_Ca (1.1, 2.1, 2.2, 2.3, 3.1, 4.1, 4.2, 5.1)
Унутрашњи-исправљачи	K_ATP · K_ir (1.1, 2.1, 2.2, 2.3, 2.4, 2.6) · GIRK/K_ir (3.1, 3.2, 3.3, 3.4) · K_ir (4.1, 4.2, 5.1, 6.1, 6.2, 7.1)
Домен тандема пора	K2P (1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 9, 10, 12, 13, 15, 16, 17, 18)

Други

M⁺: TRP катјонски канал	ТРПА (1) · ТРПЦ (1, 2, 3, 4, 4АП, 5, 6, 7) · TRPM (1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8) · TRPML (1, 2, 3) · TRPP (1, 2) · TRPV (1, 2, 3, 4, 5, 6)
Cl^-: Хлоридни канал	ANO1 · Бестрофин (1, 2) · CFTR · ЦЛЦА (1, 2, 3, 4) · CLCN (1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, КА, КБ) · CLIC (1, 2, 3, 4, 5, 6, Л1) · CLNS (1А, 1Б)
Цикличним нуклеотидом-контролисани (ФЦ)	α (1, 2, 3, 4) · β (1, 2, 3) · HCN (1, 2, 3, 4)
Порин	Аквапорин (1, 2, 3, 4, 5, 7, 8, 9) · Ањонски канали зависни од напона (1, 2, 3) · Генерална бактеријска поринска фамилија
Пропусна веза	Конексин: А (GJA1, GJA3, GJA4, GJA5, GJA8, GJA9, GJA10) · B (GJB1, GJB2, GJB3, GJB4, GJB5, GJB6, GJB7) · C (GJC1, GJC2, GJC3) · D (GJD2, GJD3, GJD4) · E (GJE1) Ineksin
Generalno	Ligandom-kontrolisani jonski kanal · Naponom-kontrolisani jonski kanal · Rastezanjem-aktivirani jonski kanal

takođe pogledajte poremećaje
B memb: cead, trns (1A, 1C, 1F, 2A, 3A1, 3A2-3, 3D), други