PDZ domen — разлика између измена
| Ред 54: | Ред 54: | ||
== Proteini koji sadrže ovaj domen == |
== Proteini koji sadrže ovaj domen == |
||
PDZ domeni su nađeni kod više hiljada poznatih proteina<ref name="pmid20509869">{{cite journal |author=Lee HJ, Zheng JJ |title=PDZ domains and their binding partners: structure, specificity, and modification |journal=Cell Commun. Signal |volume=8 |issue= |pages=8 |year=2010 |pmid=20509869 |pmc=2891790 |doi=10.1186/1478-811X-8-8 |url=}}</ref> Ti proteini su široko rasprostranjeni kod eukariota i eubakterija,<ref name="pmid9041651">{{cite journal |author=Ponting CP |title=Evidence for PDZ domains in bacteria, yeast, and plants |journal=Protein Sci. |volume=6 |issue=2 |pages=464–8 |year=1997 |month=February |pmid=9041651 |pmc=2143646 |doi=10.1002/pro.5560060225 |url=}}</ref> dok ima veoma malo primera tih proteina kod [[Archaea|-{Archaebacteria}-]]. PDZ domeni su često sa drugim [[proteinski domen|proteinskim domenima]] i te kombinacije im omogućavaju da izvršavaju njihove specifične funkcije. Na primer za -{PDZ}- domene u -{PSD}--95 proteinima je utvrđeno da su vezani sa [[SH3 domen|-{SH3}- domenom]] i [[guanilat kinaza|guanilat kinaznim]] domenom. |
|||
== Literatura == |
== Literatura == |
||
Верзија на датум 23. јануар 2011. у 04:35
 Molekulska struktura PDZ domena uključujući ljudski GOPC (Goldži-vezani PDZ protein koji sadrži motiv upredene zavojnice) | |||||||||
| Identifikatori | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Simbol | PDZ | ||||||||
| Pfam | PF00595 | ||||||||
| InterPro | IPR001478 | ||||||||
| SMART | PDZ | ||||||||
| PROSITE | PDOC50106 | ||||||||
| SCOP | 1lcy | ||||||||
| SUPERFAMILY | 1lcy | ||||||||
| |||||||||
PDZ domen je zajednički strukturni domen sa 80-90 aminokiselina koji je nađen kod signalnih proteina bakterija, kvasca, biljki, virusa[1] i životinja.[2] PDZ je akronim formiran kombinovanjem prvih slova imena tri proteina — PSD95 (engl. post synaptic density protein), DlgA (engl. Drosophila disc large tumor suppressor), i zo-1 (engl. zonula occludens-1 protein) — za koje su prvo otkriveno da imaju zajednički domen. PDZ domeni su se ranije nazivali DHR (Dlg homolognim regionom)[3] ili GLGF (glicin-leucin-glicin-fenilalanin) domenima. Ti domeni pomažu vezivanje transmembranskih proteina za citoskelet i drže na okupu signalne komplekse[4].
PDZ domeni imaju sposobnost vezivanja za kratki region C-terminusa drugih specifičnih proteina. Ti kratki regioni se vezuju za PDZ domen putem augmentacije beta ravni. Beta ravan PDZ domena se uvećava dodatkom dodatnog beta lanaca iz vezanog proteina.[5]
Proteini koji sadrže ovaj domen
PDZ domeni su nađeni kod više hiljada poznatih proteina[6] Ti proteini su široko rasprostranjeni kod eukariota i eubakterija,[2] dok ima veoma malo primera tih proteina kod Archaebacteria. PDZ domeni su često sa drugim proteinskim domenima i te kombinacije im omogućavaju da izvršavaju njihove specifične funkcije. Na primer za PDZ domene u PSD-95 proteinima je utvrđeno da su vezani sa SH3 domenom i guanilat kinaznim domenom.
Literatura
- ^ Boxus M, Twizere JC, Legros S, Dewulf JF, Kettmann R, Willems L (2008). „The HTLV-1 Tax interactome”. Retrovirology. 5: 76. PMC 2533353
. PMID 18702816. doi:10.1186/1742-4690-5-76.
- ^ а б Ponting CP (1997). „Evidence for PDZ domains in bacteria, yeast, and plants”. Protein Sci. 6 (2): 464—8. PMC 2143646 . PMID 9041651. doi:10.1002/pro.5560060225. Непознати параметар
|month=игнорисан (помоћ) Грешка код цитирања: Неисправна ознака<ref>; назив „pmid9041651” је дефинисано више пута с различитим садржајем - ^ Ponting CP, Phillips C (1995). „DHR domains in syntrophins, neuronal NO synthases and other intracellular proteins”. Trends Biochem. Sci. 20 (3): 102—3. PMID 7535955. doi:10.1016/S0968-0004(00)88973-2. Непознати параметар
|month=игнорисан (помоћ) - ^ Ranganathan R, Ross E (1997). „PDZ domain proteins: scaffolds for signaling complexes.”. Curr Biol. 7 (12): R770—3. PMID 9382826. doi:10.1016/S0960-9822(06)00401-5.
- ^ Cowburn D (1997). „Peptide recognition by PTB and PDZ domains”. Curr. Opin. Struct. Biol. 7 (6): 835—8. PMID 9434904. doi:10.1016/S0959-440X(97)80155-8. Непознати параметар
|month=игнорисан (помоћ) - ^ Lee HJ, Zheng JJ (2010). „PDZ domains and their binding partners: structure, specificity, and modification”. Cell Commun. Signal. 8: 8. PMC 2891790 . PMID 20509869. doi:10.1186/1478-811X-8-8.
