Kringl domen

Из Википедије, слободне енциклопедије
1nl2 opm.png
Boveđi protrombinski fragment 1 u kompleksu sa kalcijumom i lizofosfatidilserinom
Identifikatori
Simbol Kringl
Pfam PF00051
InterPro IPR000001
SMART KR
PROSITE PDOC00020
SCOP 1pk4
Superfamilija 1pk4
OPM protein 1nl2

Kringl domeni su autonomni proteinski domeni koji formiraju velike petlje stabilizovane sa 3 disulfidne veze. Oni učestvuju u protein-protein interakcijama sa krvnim koagulacionim faktorima. Ime kringl potiče od skandinavskog peciva na koje ove strukture podsećaju.

Kringl domen je nađen u plazminogenima, hepatocitnim faktorima rasta, protrombinu, o apolipoproteinu (a).

Ovi domeni su nađeni u mnogim koagulacionim i fibrinolitičkim proteinima. Kringl domeni učestvuju u vezivanju posrednika (e.g., membrana, drugih proteina ili fosfolipida), kao i u regulaciji proteolitičke aktivnosti.[1][2][3] Kringl domeni[4][5][6] sadrže trostruku petlju i 3 disulfidna mosta, čija conformacija je definisana brojnim vodoničnim vezama i malim segmentima antiparalelnih beta ravni. Oni se javljaju sa promenljivim brojem kopija u proteinima plazme, uključujući protrombin i urokinazni tip plasminogenog aktivatora, koji su serinske proteaze iz MEROPS peptidazne familije S1A.

Ljudski proteini koji sadrže ovaj domena[уреди]

ATF; F12; F2; HABP2; HGF; HGFAC; KREMEN1; KREMEN2; LPA; LPAL2; MST1; PIK3IP1; PLAT; PLAU; PLG; PRSS12; ROR1; ROR2;

Reference[уреди]

  1. ^ Fujikawa K, McMullen BA (1985). „Amino acid sequence of the heavy chain of human alpha-factor XIIa (activated Hageman factor)“. J. Biol. Chem. 260 (9): 5328–5341. PMID 3886654. 
  2. ^ Patthy L, Trexler M, Banyai L, Varadi A, Vali Z (1984). „Kringles: modules specialized for protein binding. Homology of the gelatin-binding region of fibronectin with the kringle structures of proteases“. FEBS Lett. 171 (1): 131–136. DOI:10.1016/0014-5793(84)80473-1. PMID 6373375. 
  3. ^ Atkinson RA, Williams RJ (1990). „Solution structure of the kringle 4 domain from human plasminogen by 1H nuclear magnetic resonance spectroscopy and distance geometry“. J. Mol. Biol. 212 (3): 541–552. DOI:10.1016/0022-2836(90)90330-O. PMID 2157850. 
  4. ^ Castellino FJ, Beals JM (1987). „The genetic relationships between the kringle domains of human plasminogen, prothrombin, tissue plasminogen activator, urokinase, and coagulation factor XII“. J. Mol. Evol. 26 (4): 358–369. DOI:10.1007/BF02101155. PMID 3131537. 
  5. ^ Patthy L (1985). „Evolution of the proteases of blood coagulation and fibrinolysis by assembly from modules“. Cell 41 (3): 657–663. DOI:10.1016/S0092-8674(85)80046-5. PMID 3891096. 
  6. ^ Takahashi K, Ikeo K, Gojobori T (1991). „Evolutionary origin of numerous kringles in human and simian apolipoprotein(a)“. FEBS Lett. 287 (1): 146–148. DOI:10.1016/0014-5793(91)80036-3. PMID 1879523. 

Spoljašnje veze[уреди]