ЕНЦОДЕ

С Википедије, слободне енциклопедије
ЕНЦОДЕ
Контент
ОписБаза података целог генома
Контакт
Истраживачки центарКалифорнијски универзитет Санта Круз
ЛабораторијаЦентер за биомолекуларне науке и инжењество
АуториBrian J Raney[1]
Примарни цитатPMID 21037257
Приступ
Веб страницаencodeproject.org
Алати
Разно

Енциклопедија ДНК елемената (ЕНЦОДЕ) је јавни истраживачки конзорцијум[2] који је успоставио УСА|амерички Национални истраживачки институт људског генома (НХГРИ) септембра 2003.[1][3][4][5] Његов примарни циљ је да се нађу сви функционални елементи људског генома.[6] Подаци генерисани у оквиру овог пројекта се депонују у јавне базе података.

Иницијални резултати пројекта су објављени 5. септембра 2012. у координираној групи од 30 чланака објављених у журналима Nature (6 публикација), Genome Biology (18 публикација), и Genome Research (6 публикација).[7][8] У публикацији са прегледом пројекта се наводи да су познате биохемијске функције за 80% људског генома.[9][10] Знатан део функционалне некодирајуће ДНК учествује у регулацији експресије кодирајућих гена.[9] Изражавање кодирајућих гена је контролисано вишеструким ребулаторним местима, која могу да буду лоцирана у близини или на знатној раздаљини од гена. Ови ресултати демонстрирају да је регулација гена далеко комплекснија него што се раније веровало.[11]

Референце[уреди | уреди извор]

  1. ^ а б Ранеy, БЈ; Цлине, МС; Росенблоом, КР; Дресзер, ТР; Леарнед, К; Барбер, ГП; Меyер, ЛР; Слоан, ЦА; Маллади, ВС; Роскин КМ; Сух ББ; Хинрицхс АС; Цлаwсон Х; Зwеиг АС; Киркуп V; Фујита ПА; Рхеад Б; Смитх КЕ; Похл А; Кухн РМ; Каролцхик D; Хаусслер D; Јим Кент (2011). „ЕНЦОДЕ wхоле-геноме дата ин тхе УЦСЦ геноме броwсер (2011 упдате)”. Нуцлеиц Ацидс Ресеарцх. 39 (Датабасе иссуе): Д871—5. ПМЦ 3013645Слободан приступ. ПМИД 21037257. дои:10.1093/нар/гкq1017. 
  2. ^ Махер, Б. (2012). „ЕНЦОДЕ: Тхе хуман енцyцлопаедиа”. Натуре. 489 (7414): 46—8. ПМИД 22962707. дои:10.1038/489046а. 
  3. ^ ЕНЦОДЕ Пројецт Цонсортиум (2011). Бецкер ПБ, ур. „А Усер'с Гуиде то тхе Енцyцлопедиа оф ДНА Елементс (ЕНЦОДЕ)”. ПЛоС Биологy. 9 (4): е1001046. ПМЦ 3079585Слободан приступ. ПМИД 21526222. дои:10.1371/јоурнал.пбио.1001046. 
  4. ^ Цонсортиум, ЕНЦОДЕ Пројецт; Бирнеy, Еwан; Стаматоyаннопоулос, ЈА; Дутта, А; Гуигó, Р; Гингерас, ТР; Маргулиес, ЕХ; Wенг, З; Снyдер, M; Дермитзакис ЕТ; et al. (2007). „Идентифицатион анд аналyсис оф фунцтионал елементс ин 1% оф тхе хуман геноме бy тхе ЕНЦОДЕ пилот пројецт”. Натуре. 447 (7146): 799—816. Бибцоде:2007Натур.447..799Б. ПМЦ 2212820Слободан приступ. ПМИД 17571346. дои:10.1038/натуре05874. 
  5. ^ Гуигó, Р; Флицек, П; Абрил, ЈФ; Реyмонд, А; Лагарде, Ј; Деноеуд, Ф; Антонаракис, С; Асхбурнер, M; Бајиц, ВБ; Еwан Бирнеy; Цастело Р; Еyрас Е; Уцла C; Гингерас ТР; Харроw Ј; Хуббард Т; Леwис СЕ; Реесе МГ (2006). „ЕГАСП: Тхе хуман ЕНЦОДЕ Геноме Аннотатион Ассессмент Пројецт”. Геноме Биологy. 7: С2. ПМЦ 1810551Слободан приступ. ПМИД 16925836. дои:10.1186/гб-2006-7-с1-с2. 
  6. ^ Натионал Хуман Геноме Ресеарцх Институте. „Тхе ЕНЦОДЕ Пројецт: ЕНЦyцлопедиа Оф ДНА Елементс”. У.С. Натионал Институтес оф Хеалтх. 
  7. ^ „ЕНЦОДЕ пројецт ат УЦСЦ”. ЕНЦОДЕ Цонсортиум. Приступљено 5. 9. 2012. 
  8. ^ Wалсх, Ф. (5. 9. 2012). „Детаилед мап оф геноме фунцтион”. ББЦ Неwс. Архивирано из оригинала 05. 09. 2012. г. Приступљено 6. 9. 2012. 
  9. ^ а б Бернстеин БЕ, Бирнеy Е, Дунхам I, Греен ЕД, Гунтер C, Снyдер M (2012). „Ан интегратед енцyцлопедиа оф ДНА елементс ин тхе хуман геноме”. Натуре. 489 (7414): 57—74. Бибцоде:2012Натур.489...57Т. ПМИД 22955616. дои:10.1038/натуре11247. 
  10. ^ Тиммер, Ј. (10. 9. 2012). „Мост оф wхат yоу реад wас wронг: хоw пресс релеасес реwроте сциентифиц хисторy”. Стафф / Фром тхе Миндс оф Арс. Арс Тецхница. Приступљено 10. 9. 2012. 
  11. ^ Пенниси, Е. (2012). „Геномицс. ЕНЦОДЕ пројецт wритес еулогy фор јунк ДНА”. Сциенце. 337 (6099): 1159, 1161. ПМИД 22955811. дои:10.1126/сциенце.337.6099.1159. 

Види још[уреди | уреди извор]

Спољашње везе[уреди | уреди извор]