Ras superfamilija

Из Википедије, слободне енциклопедије
Hras surface colored by conservation.png
H-Ras struktura PDB 121p. Površina je obojena po stepenu konzervacije: zlatno - najočuvaniji deo.
Identifikatori
Simbol Ras
Pfam PF00071
InterPro IPR013753
PROSITE PDOC00017
SCOP 5p21
Superfamilija 5p21
OPM protein 1uad
CDD cd00882

Ras superfamilija je proteinska superfamilija malih GTPaza, koje su međusobno srodne u izvesnoj meri sa Ras potfamilijom. Ključni ljudski članovi su KRAS, NRAS, i HRAS.

Postoji više od sto proteina u Ras superfamiliji.[1] Ras superfamilija se deli u osam glavnih familija na osnovu strukture, sekvence i funkcije: Ras, Rad, Rab, Rap, Ran, Ro, Rheb, Rit, i Arf. Miro je nedavni dodatak superfamiliji.

Svaka potfamilija ima zajednički osnovni G domen, koji omogućava esencijalne funkcije GTPaze i nukleotidne razmene.

Okružujuća sekvenca pomaže u određivanju funkcionalne specifičnosti malih GTPaza, na primer umetnuta petlja koja je uobičajena kod Ro potfamilije, specifično doprinosi vezivanju za efektorske proteine poput IQGAP-a i WASP-a.

Ras familija je generalno odgovorna za ćelijsku proliferaciju, Ro za ćelijsku morfologiju, Ran za nuklearni transport, a Rab i Arf za vezikularni transport[2].

Potfamilije i članovi[уреди]

Sledeća lista sadrži ljudske proteine koji pripadaju Ras superfamiliji:[1]

Pregled
Potfamilija Funkcija Članovi
Ras ćelijska proliferacija [2] DIRAS1; DIRAS2; DIRAS3; ERAS; GEM; HRAS; KRAS; MRAS; NKIRAS1; NKIRAS2; NRAS; RALA; RALB; RAP1A; RAP1B; RAP2A; RAP2B; RAP2C; RASD1; RASD2; RASL10A; RASL10B; RASL11A; RASL11B; RASL12; REM1; REM2; RERG; RERGL; RRAD; RRAS; RRAS2
Ro citoskeletalna dinamika/morfologija[2] RHOA; RHOB; RHOBTB1; RHOBTB2; RHOBTB3; RHOC; RHOD; RHOF; RHOG; RHOH; RHOJ; RHOQ; RHOU; RHOV; RND1; RND2; RND3; RAC1; RAC2; RAC3; CDC42
Rab membranska razmena RAB1A; RAB1B; RAB2; RAB3A; RAB3B; RAB3C; RAB3D; RAB4A; RAB4B; RAB5A; RAB5B; RAB5C; RAB6A; RAB6B; RAB6C; RAB7A; RAB7B; RAB7L1; RAB8A; RAB8B; RAB9; RAB9B; RABL2A; RABL2B; RABL4; RAB10; RAB11A; RAB11B; RAB12; RAB13; RAB14; RAB15; RAB17; RAB18; RAB19; RAB20; RAB21; RAB22A; RAB23; RAB24; RAB25; RAB26; RAB27A; RAB27B; RAB28; RAB2B; RAB30; RAB31; RAB32; RAB33A; RAB33B; RAB34; RAB35; RAB36; RAB37; RAB38; RAB39; RAB39B; RAB40A; RAB40AL; RAB40B; RAB40C; RAB41; RAB42; RAB43
Rap Ćelijska adhezija RAP1A; RAP1B; RAP2A; RAP2B; RAP2C
Arf vesicular transport[2] ARF1; ARF3; ARF4; ARF5; ARF6; ARL1; ARL2; ARL3; ARL4; ARL5; ARL5C; ARL6; ARL7; ARL8; ARL9; ARL10A; ARL10B; ARL10C; ARL11; ARL13A; ARL13B; ARL14; ARL15; ARL16; ARL17; TRIM23, ARL4D; ARFRP1; ARL13B
Ran nukleusni transport RAN
Rheb mTOR put RHEB; RHEBL1
RGK RRAD; GEM; REM; REM2
Rit RIT1; RIT2
Miro mitochondrial transport RHOT1; RHOT2

Neklasifikovani:

Reference[уреди]

  1. ^ а б Wennerberg K, Rossman KL, Der CJ (March 2005). „The Ras superfamily at a glance“. J. Cell. Sci. 118 (Pt 5): 843–6. DOI:10.1242/jcs.01660. PMID 15731001. 
  2. ^ а б в г Munemitsu S, Innis M, Clark R, McCormick F, Ullrich A, Polakis P. (1990). „Molecular cloning and experssion of a G25K cDNA, the human homolog of the yeast cell cycle gene CDC42“. Mol Cell Biol 10 (11): 5977–82. ISSN 0270-7306. PMC 361395. PMID 2122236. 

Vidi još[уреди]