Ро фактор — Википедија

ρ фактор (Ро фактор) је прокариотски протеин који учествује у терминацији транскрипције. Ро фактор се везује за транскрипциони терминатор, изложени регион једноланчане РНК (сегмент са 72 нуклеотида) иза отвореног оквира читања на ГЦ богатим секвенцама којима недостаје очигледана секундарна структура.^[1]

Ро фактор је есенцијални транскрипциони протеин код прокариота. У бактерији Escherichia coli, он је хексамер са ~275 кД и идентичним подјединицама. Свака подјединица садржи домен РНК везивања и домен АТП хидролизе. Ро је члан фамилије АТП зависних хексамерних хеликаза које делују путем обмотавање нуклеиских киселина око расцепа који се пружа око целокупног хексамера. Ро функционише као помоћни фактор за РНК полимеразе.

Референце[уреди | уреди извор]

^ Slonczewski, Joan, and John Watkins. Foster. Microbiology: An Evolving Science. New York: W.W. Norton &, 2009. Print.

Спољашње везе[уреди | уреди извор]

Рхо+Фацтор на US National Library of Medicine Medical Subject Headings (MeSH)

Транскрипциони фактори и интрацелуларни рецептори

(1) Основни домени

(1.1) Основни леуцински затварач (бЗИП)	Активирајући транскрипциони фактор (ААТФ, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7) • АП-1 (ц-Фос, ФОСБ, ФОСЛ1, ФОСЛ2, ц-Јун, ЈУНБ, ЈУНД) • БАЦХ (1, 2) • БАТФ • БЛЗФ1 • C/ЕБП (α, β, γ, δ, ε, ζ) • ЦРЕБ (1, 3, Л1) • ЦРЕМ • ДБП • ДДИТ3 • ГАБПА • ХЛФ • МАФ (Б, Ф, Г, К) • НФЕ (2, Л1, Л2) • НФИЛ3 • НРЛ • НРФ1 • XБП1
(1.2) Основни хеликс-петља-хеликс (бХЛХ)	АТОХ1 • АхР • АХРР • АРНТ • АСЦЛ1 • БХЛХБ2 • БМАЛ (АРНТЛ, АРНТЛ2) • ЦЛОЦК • ЕПАС1 • ХАНД (1, 2) • ХЕС (5, 6) • ХЕY (1, 2, L) • ХЕС1 • ХИФ (1А, 3А) • ИД (1, 2, 3, 4) • ЛYЛ1 • МXД4 • МYЦЛ1 • МYЦН • Мyогениц регулаторни фактори (МyоД, Мyогенин, МYФ5, МYФ6) • Неурогенини (1, 2, 3) • НеуроД (1, 2) • НПАС (1, 2, 3) • ОЛИГ (1, 2) • Пхо4 • Сцлераxис • ТАЛ (1, 2) • Тwист • УСФ1
(1.3) бХЛХ-ЗИП	АП-4 • МАX • МИТФ • МНТ • MLX • МXИ1 • Мyц • СРЕБП (1, 2)
(1.4) НФ-1	НФИ (А, Б, C, X) • СМАД (Р-СМАД (1, 2, 3, 5, 9) - I-СМАД (6, 7) - 4)
(1.5) РФ-X	РФX (1, 2, 3, 4, 5, АНК)
(1.6) Основни хеликс-размак-хеликс (бХСХ)	АП-2 (α, β, γ, δ, ε)

(2) ДНА-везујући домени цинковог прста

(2.1) Нуклеарни рецептор (Цyс₄)	потфамилија 1 (Тироидни хормон (α, β), ЦАР, ФXР, ЛXР (α, β), ППАР (α, β/δ, γ), ПXР, РАР (α, β, γ), РОР (α, β, γ), Рев-ЕрбА (α, β), ВДР) потфамилија 2 (ЦОУП-ТФ (I, II), Еар-2, ХНФ4 (α, γ), ПНР, РXР (α, β, γ), Тестикуларни рецептор (2, 4), ТЛX) потфамилија 3 (Стероидни хормон (Андроген, Естроген (α, β), Глукокортикоид, Минералокортикоид, Прогестерон), Естроген-везани (α, β, γ)) потфамилија 4 НУР (НГФИБ, НОР1, НУРР1) • потфамилија 5 (ЛРХ-1, СФ1) • потфамилија 6 (ГЦНФ) • потфамилија 0 (ДАX1, СХП)
(2.2) Други Цyс₄	ГАТА (1, 2, 3, 4, 5, 6) • МТА (1, 2, 3) • ТРПС1
(2.3) Цyс₂Хис₂	Генерални транскрипциони фактори (ТФИИА, ТФИИБ, ТФИИД, ТФИИЕ, ТФИИФ (1, 2), ТФИИХ (1, 2, 4, 2И, 3А, 3Ц1, 3Ц2)) АТБФ1 • БЦЛ (6, 11А, 11Б) • ЦТЦФ • Е4Ф1 • ЕГР (2, 3) • ЕРВ3 • ГФИ1 • ГЛИ-Круппел фамилија (1, 2, 3, РЕСТ, С2, YY1) • ХИЦ (1, 2) • ХИВЕП (1, 2, 3) • ИКЗФ (1, 2, 3) • ИЛФ (2, 3) • КЛФ (2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 17) • МТФ1 • МYТ1 • ОСР1 • СП (1, 2, 4, 7) • WТ1 • Збтб7 (7А, 7Б) • ЗБТБ (16, 17, 20, 32, 33, 40) • цинк прст (3, 7, 9, 10, 19, 22, 24, 33Б, 34, 35, 41, 43, 44, 51, 74, 143, 146, 148, 165, 202, 217, 219, 238, 239, 259, 267, 268, 281, 295, 318, 330, 346, 350, 365, 366, 384, 423, 451, 452, 471, 593, 638, 649, 655)
(2.4) Цyс₆	ХИВЕП1
(2.5) Наизменична композиција	АИРЕ • ДИДО1 • ГРЛФ1 • ИНГ (1, 2, 4) • ЈАРИД (1А, 1Б, 1Ц, 1Д, 2) • ЈМЈД1Б

(3) Хеликс-завој-хеликс домени

(3.1) Хомеодомен	АРX • CDX (1, 2) • ЦРX • ЦУТЛ1 • ДБX (1, 2) • DLX (3, 4, 5) • ЕМX2 • ЕН (1, 2) • ФХЛ (1, 2, 3) • ХЕСX1 • ХХЕX • ХЛX • Хомеобоx (А1, А2, А3, А4, А5, А7, А9, А10, А11, А13, Б1, Б2, Б3, Б4, Б5, Б6, Б7, Б8, Б9, Б13, Ц4, Ц5, Ц6, Ц8, Ц9, Ц10, Ц11, Ц13, Д1, Д3, Д4, Д8, Д9, Д10, Д11, Д12, Д13) • ХОПX • ИРX (1, 2, 3, 4, 5, 6, МКX) • ЛМX (1А, 1Б) • МЕИС (1, 2) • МЕОX2 • МНX1 • МСX (1, 2) • НАНОГ • НКX (2-1, 2-2, 2-3, 2-5, 3-1, 3-2, 6-1, 6-2) • ПБX (1, 2, 3) • ПХФ (1, 3, 6, 8, 10, 16, 17, 20, 21А) • ПИТX (1, 2, 3) • ПОУ домен (ПИТ-1, БРН-3: А, Б, C, Октамер транскрипциони фактор: 1, 2, 3/4, 6, 7, 11) • ОТX (1, 2) • ПДX1 • ЗЕБ (1, 2)
(3.2) Паиред боx	ПАX (1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9)
(3.3) Форк глава / wингед хеликс	Е2Ф (1, 2, 3, 4, 5) • ФОX протеини (Ц1, Ц2, Д3, Е1, Г1, Х1, К2, Л2, М1, Н3, О1, О3, О4, П1, П2, П3)
(3.4) Фактори топлотног шока	ХСФ (1, 2, 4)
(3.5) Триптофан кластери	ЕЛФ (2, 4, 5) • ЕГФ • ЕЛК (1, 3, 4) • ЕРФ • ЕРГ • ЕТС (1, 2, СПИБ) • ЕТВ (1, 4, 5, 6) • ФЛИ1 • Интерферон регулаторни фактори (1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8) • МYБ • МYБЛ2
(3.6) ТЕА домен	транскрипциони појачивач фактор (1, 2, 3, 4)

(4) β-Сцаффолд фактори са мањим жљебним контактима

(4.1) Рел хомологни регион	НФ-κБ (НФКБ1, НФКБ2, РЕЛ, РЕЛА, РЕЛБ) • НФАТ (Ц1, Ц2, Ц3, Ц4, 5)
(4.2) СТАТ	СТАТ (1, 2, 3, 4, 5, 6)
(4.3) п53	п53 • ТБX (1, 2, 3, 5, 19, 21, 22, Брахиури, ТБР1)
(4.4) МАДС кутија	Меф2 (А, Б, C, D) • СРФ
(4.6) ТАТА везујући протеини	ТБП • ТБПЛ1
(4.7) Група високе покретљивости	ХМГБ (1, 2, 3) • ХНФ (1А, 1Б) • ЛЕФ1 • СОX (1, 2, 3, 4, 5, 6, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 18, 21) • СРY • ССРП1 • ТЦФ (3, 4) • ТОX (1, 2, 3, 4)
(4.10) Домен хладног шока	ЦСДА, YБX1
(4.11) Рунт	ЦБФ (ЦБФА2Т2, ЦБФА2Т3, РУНX1, РУНX2, РУНX3, РУНX1Т1)

(0) Други транскрипциони фактори

(0.2) ХМГИ(Y)	ХМГА (1, 2) • ХБП1
(0.3) Џеп домен	Рб • РБЛ1 • РБЛ2
(0.5) АП-2/ЕРЕБП-везани фактори	Апетала 2 • ЕРЕБП • Б3
(0.6) Разно	АРИД (1А, 1Б, 2, 3А, 3Б, 4А) • ЦАП • ИФИ (16, 35) • МЛЛ (2, 3, Т1) • МНДА • НФY (А, Б, C) • Ро/Сигма

види исто транскрипциони фактор/корегулатор недостатака
Б бсyн: днк (репл, цyцл, рецо, репр) · тсцр (фацт, тцрг, нуцл, рнат, репт, пттс) · тлтн (рису, пттл, неxн) · днаб, рнаб/рунп · стру (домн, 1°, 2°, 3°, 4°)