Структурна геномика
Структурна геномика настоји да опише тродимензионе структуре свих протеина кодираних у датом геному. Овај на геному засновани приступ омогућава примену метода одређивања структуре високог капацитета путем комбинације експериментних метода и моделулског моделовања. Главна разлика између структурне геномике и традиционалног структурног предвиђања је да структурна геномика покушава да одреди структуру свих протеина кодираних геномом, уместо да се усредсређује на један специфични протеин. Са доступношћу потпуних геномских секвенци, структурна предвиђања се могу брже вршити путем комбинације експерименталних и теоријских приступа, посебно зато што велики број доступних секвенцираних генома и решених кристалних структура омогућава моделовање протеинских структура користећи претходно ређене хомологе.[1]
За разлику од традиционалне структурне биологије, одређивање протеинске структуре применом структурне геномике се често врши пре него што је позната протеинска функција. Протеинске структуре су блиско повезане са функцијом протеина, те структурна геномика има потенцијал да пружи инфорације о могућим протеинским функцијама. Осим изучавања протеинских функција, структурна геномика се може користити за идентификацију нових протеинских савијања и потентијалних биолошких циљева са применом у процесу откривања лекова.
Референце
[уреди | уреди извор]- ^ Цхандониа ЈМ, Бреннер СЕ (2006). „Тхе импацт оф струцтурал геномицс: еxпецтатионс анд оутцомес”. Сциенце. 311 (5759): 347—51. ПМИД 16424331. дои:10.1126/сциенце.1121018.
Литература
[уреди | уреди извор]- Хоофт РW, Вриенд Г, Сандер C, Абола ЕЕ (1996). „Еррорс ин протеин струцтурес”. Натуре. 381 (6580): 272. ПМИД 8692262. дои:10.1038/381272а0.
- Марсден РЛ, Леwис ТА, Оренго ЦА (2007). „Тоwардс а цомпрехенсиве струцтурал цовераге оф цомплетед геномес: а струцтурал геномицс виеwпоинт”. БМЦ Биоинформатицс. 8: 86. ПМЦ 1829165
. ПМИД 17349043. дои:10.1186/1471-2105-8-86. - Бакер ЕН, Арцус ВЛ, Лотт ЈС (2003). „Протеин струцтуре предицтион анд аналyсис ас а тоол фор фунцтионал геномицс”. Аппл. Биоинформатицс. 2 (3 Суппл): С3—10. ПМИД 15130810.
- Гоулдинг ЦW; Перрy Љ; Андерсон D; et al. (2003). „Струцтурал геномицс оф Мyцобацтериум туберцулосис: а прелиминарy репорт оф прогресс ат УЦЛА”. Биопхyс. Цхем. 105 (2-3): 361—70. ПМИД 14499904.
- Сколницк Ј, Фетроw ЈС, Колински А (2000). „Струцтурал геномицс анд итс импортанце фор гене фунцтион аналyсис”. Нат. Биотецхнол. 18 (3): 283—7. ПМИД 10700142. дои:10.1038/73723.
