DNK polimeraza III holoenzim

Из Википедије, слободне енциклопедије

DNK polimeraza III holoenzim je primarni enzimski kompleks koji učestvuje u prokariotskoj replikaciji DNK. Thomas Kornberg i Malkolm Gefter su otkrili ovaj kompleks 1970. Kompleks je veoma efikasan, i.e. njegov broj dodatih nukleotida po vezivanju je visok. Pri replikaciji E.coli genoma on funkcioniše zajedno sa drugim DNK polimerazama (Pol I, Pol II, Pol IV, i Pol V). Kao primarni holoenzim procesa replikacije, DNK Pol III holoenzim takođe poseduje sposobnost korekture kojom se ispravljaju replikacione greške u 3'->5' smeru posredstvom dejstva egzonuklease. DNK Pol III je komponenta replizoma, koji je lociran na replikacionoj račvi.[1][2]

Komponente[уреди]

DNK polimeraza III, delta podjedinica
PDB 1xxh EBI.jpg
atpgs vezan za e. coli kompleks vodiča klampe
Identifikatori
Simbol DNA_pol3_delta
Pfam PF06144
Pfam klan CL0023
InterPro IPR010372
SCOP 1jql
Superfamilija 1jql
DNK polimeraza III, delta podjedinica, C terminal
PDB 1xxi EBI.jpg
adp vezan za e. coli kompleks vodiča klampe
Identifikatori
Simbol DNApol3-delta_C
Pfam PF09115
InterPro IPR015199
SCOP 1a5t
Superfamilija 1a5t
Bakterijska DNK polimeraza III, alfa podjedinica
Identifikatori
Simbol DNA_pol3_alpha
Pfam PF07733
InterPro IPR011708
DNA polimeraza III, podjedinica tau, domen IV
Identifikatori
Simbol DNA_pol3_tau_4
Pfam PF12168
InterPro IPR022001
DNK polimeraza III, teta podjedinica
PDB 2ido EBI.jpg
Struktura e. coli Pol III epsilon-hot korekcioni kompleks
Identifikatori
Simbol DNA_pol3_theta
Pfam PF06440
InterPro IPR009052
SCOP 1du2
Superfamilija 1du2
DNK polimeraza III, či podjedinica, HolC
PDB 1em8 EBI.jpg
Kristalna struktura či i psi podjedinice heterodimera DNK Pol III
Identifikatori
Simbol DNA_pol3_chi
Pfam PF04364
InterPro IPR007459
SCOP 1em8
Superfamilija 1em8
DNK polimeraza III, tau podjedinica V u interakciji sa alfa
Identifikatori
Simbol DNA_pol3_tau_5
Pfam PF12170
InterPro IPR021029

Replizom se sastoji od sledećeg:

  • 2 DNK Pol III enzima, svaki od njih sadrži α, ε and θ podjedinice.
    • α podjedinica ima polimeraznu aktivnost.
    • ε podjedinica ima 3'-5' egzonukleaznu aktivnost.
    • θ podjedinica stimuliše korekturu ε podjecinice.
  • 2 β jedinice omogučavaju pomeranje DNK klamfe
  • 2 τ jedinice dimerizuju dva sržna enzima (α, ε, i θ podjedinice).
  • 1 γ jedinica pomaže β podjedinicama pri vezivanju za DNK.
  • Χ i Ψ formiraju 1:1 kompleks i vezuju se za γ ili τ.[1]

Reference[уреди]

  1. ^ а б Olson, M. W.; Dallmann, H. G.; McHenry, C. S. (1995). „DnaX complex of Escherichia coli DNA polymerase III holoenzyme. The chi psi complex functions by increasing the affinity of tau and gamma for delta.delta' to a physiologically relevant range“. The Journal of Biological Chemistry 270 (49): 29570–29577. PMID 7494000. 
  2. ^ Kelman, Z.; O'Donnell, M. (1995). „Dna Polymerase III Holoenzyme: Structure and Function of a Chromosomal Replicating Machine“. Annual Review of Biochemistry 64: 171. DOI:10.1146/annurev.bi.64.070195.001131. 

Literatura[уреди]

Spoljašnje veze[уреди]