DnaB helikaza

N terminalni domen DnaB slične helikaze
	NMR struktura N terminalnog domena E. coli DnaB helikaze
Identifikatori
Simbol	DnaB
Pfam	PF00772
InterPro	IPR007693
SCOP	1jwe
Superfamilija	1jwe
Dostupne PDB strukture:
Pfam	structures
PDB	RCSB PDB; PDBe
PDBsum	strukturni pregled

DnaB helikaza je bakterijski enzim koji otvara replikacionu viljušku tokom replikacije DNK. Mehanizam kojim DnaB izvodi ATP hidrolizu radi translokacije duž DNK i denaturiše dupleks nije poznat. Promena kvaternarne strukture proteina koja obuhvata dimerizaciju N-terminusnog domena je uočena i moguće je da do nje dolazi tokom enzimskog ciklusa.^[1] Kad se DnaB inicijalno veže za dnaA, on se asociara sa dnaC, negativnim regulatorom. Nakon DnaC disocijacije, DnaB se vezuje za dnaG.^[2]

N-terminal ima multiheliksnu strukturu koja formira ortogonalni svežanj.^[1] C-terminusni domen sadrži mesto vezivanja ATP-a.

Reference [уреди]

^ ^а ^б Fass D, Bogden CE, Berger JM (June 1999). „Crystal structure of the N-terminal domain of the DnaB hexameric helicase“. Structure 7 (6): 691–8. PMID 10404598.
^ Ya-Bin Lu, Pillarisetty V. A. L. Ratnakar, Bidyut K. Mohanty, and Deepak Bastia (November 1996). „Direct physical interaction between DnaG primase and DnaB helicase of Escherichia coli is necessary for optimal synthesis of primer RNA“. PNAS 93 (23): 12902-12907.