Бета-пропелер
| WД домен, Г-бета понављање | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 Тракасти дијаграм C-терминалног WД40 домена протеина Tup1 (транскрипционог корепресора код квасца), који поприма облик бета-пропелера са седам лопатица. Трака је обојена од плавог Н-терминуса до црвеног C-терминуса.[1] | |||||||||
| Идентификатори | |||||||||
| Симбол | WД40 | ||||||||
| Пфам | ПФ00400 | ||||||||
| Пфам клан | ЦЛ0186 | ||||||||
| ИнтерПро | ИПР001680 | ||||||||
| ПРОСИТЕ | ПДОЦ00574 | ||||||||
| СЦОП | 1гп2 | ||||||||
| СУПЕРФАМИЛY | 1гп2 | ||||||||
| ЦДД | цд00200 | ||||||||
| |||||||||
У структурној биологији, бета-пропелер је тип све-β протеинског савијања које има облик бета равни са карактеристичном групом од 4 до 8 лопатица које су торусно распоређене око централне осе. Свака раван типично има четири антипарална β-ланца. Они су повијени тако да су први и четврти ланац скоро међусобно нормални. Активно место ензима се обично налази у отвору формираном у центру пропелера од петљи које повезују узастопне четвороланчане мотиве. Мурзин је предложио геометријски модел за описивање структурних принципа бета пропелера.[2] По том моделу пропелер са седам лопатица је најповољнији са геометријског гледишта.
Спољашње везе[уреди | уреди извор]
- СЦОП 4-бладед бета пропеллерс
- СЦОП 5-бладед бета пропеллерс
- СЦОП 6-бладед бета пропеллерс
- СЦОП 7-бладед бета пропеллерс
- СЦОП 8-бладед бета пропеллерс
Референце[уреди | уреди извор]
- ^ PDB: 1ерј; Спрагуе ЕР, Редд МЈ, Јохнсон АД, Wолбергер C (2000). „Струцтуре оф тхе C-терминал домаин оф Туп1, а цорепрессор оф трансцриптион ин yеаст”. ЕМБО Ј. 19 (12): 3016—27. ПМЦ 203344
. ПМИД 10856245. дои:10.1093/ембој/19.12.3016.
- ^ Мурзин АГ (1992). „Струцтурал принциплес фор тхе пропеллер ассемблy оф бета-схеетс: тхе преференце фор севен-фолд сyмметрy”. Протеинс. 14 (2): 191—201. ПМИД 1409568. дои:10.1002/прот.340140206.
Литература[уреди | уреди извор]
- Branden C, Tooze J. (1999). Introduction to Protein Structure 2nd ed. Garland Publishing: New York, NY.