FYVE domen

Из Википедије, слободне енциклопедије
FYVE cinkov prst
1joc.png
Rani endozomni antigen 1 (EEA1), dimer sa lipidima.[1]
Identifikatori
Simbol FYVE
Pfam PF01363
InterPro IPR000306
PROSITE PDOC50178
SCOP 1vfy
Superfamilija 1vfy
OPM protein 62
OPM protein 1vfy

U molekularnoj biologiji FYVE cinkov prst domen je dobio ime po grupi od četiri proteina bogatih cisteinom: Fab 1 (kvaščani ortolog proteina PIKfyve), YOTB, Vac 1 (transportni protein vezikula), i EEA1, kod kojih je nađen. FYVE domeni vezuju fosfatidilinozitol 3-fosfat,[2] na način koji je zavistan od od koordinacije metalnih jona i od baznih aminokiselina. FYVE domen se umeće u ćelijske membrane na način koji je zavistan od pH vrednosti.[3] Ovaj domen učestvuje u vakuolarnom sortiranju proteina i funkcionisanju endozoma.[4]

Struktura[уреди]

FYVE domen se sastoji od dve male beta ukosnice (ili cinkova zglavka) čemu sledi alfa heliks.[5] FYVE prst vezuje dva jona cinka. On ima osam pozicija koje potencijalno mogu da sadrže cink, i karakterističan je po tome što ima bazne aminokiseline oko cisteina. Mnogi članovi ove familije takođe sadrže dva histidina u motivu:

R+HHC+XCG, gde + označava naelektrisane ostatke, a X bilo koji ostatak

FYVE prst je strukturno sličan sa RING domenom i PHD prstom.

Primeri[уреди]

Sledeći ljudski proteini sadrže FYVE domen:

Reference[уреди]

  1. Dumas JJ; Merithew E; Sudharshan E; et al. (2001). „Multivalent endosome targeting by homodimeric EEA1”. Mol. Cell. 8 (5): 947—58. doi:10.1016/S1097-2765(01)00385-9. PMID 11741531. 
  2. Gaullier JM, Simonsen A, D'Arrigo A, Bremnes B, Stenmark H, Aasland R (1998). „FYVE fingers bind PtdIns(3)P”. Nature. 394 (6692): 432—3. doi:10.1038/28767. PMID 9697764. 
  3. He J; Vora M; Haney RM; et al. (2009). „Membrane insertion of the FYVE domain is modulated by pH”. Proteins. 76 (4): 852—60. doi:10.1002/prot.22392. PMC 2909462Слободан приступ. PMID 19296456. 
  4. Leevers SJ, Vanhaesebroeck B, Waterfield MD (1999). „Signalling through phosphoinositide 3-kinases: the lipids take centre stage”. Curr. Opin. Cell Biol. 11 (2): 219—25. doi:10.1016/S0955-0674(99)80029-5. PMID 10209156. 
  5. Misra S, Hurley JH (1999). „Crystal structure of a phosphatidylinositol 3-phosphate-specific membrane-targeting motif, the FYVE domain of Vps27p”. Cell. 97 (5): 657—66. doi:10.1016/S0092-8674(00)80776-X. PMID 10367894. 

Literatura[уреди]

  • Stenmark H, Aasland R, Toh BH, D'Arrigo A (1996). „Endosomal localization of the autoantigen EEA1 is mediated by a zinc-binding FYVE finger”. J. Biol. Chem. 271 (39): 24048—54. PMID 8798641. 
  • Stenmark H, Aasland R (1999). „FYVE-finger proteins--effectors of an inositol lipid”. J. Cell. Sci. 112 (Pt 23): 4175—83. PMID 10564636.