ЛИМ домен
| ЛИМ домен | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 Структуре ЛИМ домена из Пинч протеина. Атоми цинка су приказани сиво. | |||||||||
| Идентификатори | |||||||||
| Симбол | ЛИМ | ||||||||
| Пфам | ПФ00412 | ||||||||
| ИнтерПро | ИПР001781 | ||||||||
| ПРОСИТЕ | ПДОЦ50178 | ||||||||
| СЦОП | 1цтл | ||||||||
| СУПЕРФАМИЛY | 1цтл | ||||||||
| |||||||||
ЛИМ домени су протеински структурни домени, који се састоје од два суседна домена цинковог прста, раздвојена са две хидрофобне аминокиселине.[1] Они су добили име по њиховом открићу у протеинима Lin11, Isl-1 и Mec-3.[2] Показано је да протеини који садрже ЛИМ домен учествују у цитоскелеталној организацији, развоју органа и онкогенези. ЛИМ домени посредују протеин-протеин интеракције које су критичне за ћелијске процесе.
ЛИМ домени имају високо дивергентне секвенце, изузев појединих остатака. Дивергенција секвенци омогућава постојање мноштва различитих места везивања у истом основном домену. Конзервирани остаци учествују у везивању цинка или су хидрофобна основа протеина. ЛИМ домени имају следећу секвенцу:
[C]-[X]2-4-[C]-[X]13-19-[W]-[H]-[X]2-4-[C]-[F]-[LVI]-[C]-[X]2-4-[C]-[X]13-20-C-[X]2-4-[C]
ЛИМ домени се често јављају у умношцима, као што је то случај код протеина ТЕС и ЛМО4. Они такође могу да буду везани за друге домене, чиме се омогучава везивање и сортирање, нпр. ЛИМ киназе.
Референце[уреди | уреди извор]
- ^ Кадрмас ЈЛ, Бецкерле MC (2004). „Тхе ЛИМ домаин: фром тхе цyтоскелетон то тхе нуцлеус”. Нат. Рев. Мол. Целл Биол. 5 (11): 920—31. ПМИД 15520811. дои:10.1038/нрм1499.
- ^ Бацх I (2000). „Тхе ЛИМ домаин: регулатион бy ассоциатион”. Мецх. Дев. 91 (1–2): 5—17. ПМИД 10704826. дои:10.1016/С0925-4773(99)00314-7.