DNK stega
Pogled od gore i sa strane na homotrimer ljudske PCNA klizne stege (boje duge, N-terminus = plavo, C-terminus = crveno) sa dvolančanom DNK u centralnoj pori (magenta).[1]
DNK stega, poznata i kao klizeća stega, je proteinska struktura koja služi kao faktor progresije DNK replikacije. Ona je kritična komponenta DNK polimeraze III. Klamfa se vezuje za DNK polimerazu i sprečava disocijaciju tog enzima sa templata DNK lanca. Protein–protein interakcije između stege i proteaze su jače i specifičnije nego direktne interakcije između polimeraze i templeta, DNK lanca. Jedan od korak koji ogračava brzinu reakcije DNK sinteze je vezivanje polimeraze sa DNK templetom, te prisustvo klizeće stege dramatično povećava broj nukleotida koje polimeraza može da doda u rastući lanac tokom pojedinačnog vezivanja. Prisustvo DNK stege može da povisi brzinu DNK sinteze oko 1.000 puta.[2]
Reference
[уреди | уреди извор]- ^ PDB: 1W60; Kontopidis G, Wu SY, Zheleva DI, Taylor P, McInnes C, Lane DP, Fischer PM, Walkinshaw MD (2005). „Structural and biochemical studies of human proliferating cell nuclear antigen complexes provide a rationale for cyclin association and inhibitor design”. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 102 (6): 1871—6. PMC 548533
. PMID 15681588. doi:10.1073/pnas.0406540102.
- ^ V. Mizrahi; R. N. Henrie; J. F. Marlier; K. A. Johnson; S. J. Benkovic (1985). „Rate-limiting steps in the DNA polymerase I reaction pathway”. Biochemistry. 24 (15): 4010—4018. doi:10.1021/bi00336a031.
Literatura
[уреди | уреди извор]- Clamping down on pathogenic bacteria Архивирано 2013-08-02 на сајту Archive.today – how to shut down a key DNA polymerase complex. Quips at PDBe
- Watson JD, Baker TA, Bell SP, Gann A, Levine M, Losick R (2004). Molecular Biology of the Gene. San Francisco: Pearson/Benjamin Cummings.
Spoljašnje veze
[уреди | уреди извор]- SCOP - DNK stega
- clamp+protein+DnaN,+E+coli на US National Library of Medicine Medical Subject Headings (MeSH)