DNK polimeraza III holoenzim

Из Википедије, слободне енциклопедије
Иди на навигацију Иди на претрагу

DNK polimeraza III holoenzim je primarni enzimski kompleks koji učestvuje u prokariotskoj replikaciji DNK. Thomas Kornberg i Malkolm Gefter su otkrili ovaj kompleks 1970. Kompleks je veoma efikasan, i.e. njegov broj dodatih nukleotida po vezivanju je visok. Pri replikaciji E.coli genoma on funkcioniše zajedno sa drugim DNK polimerazama (Pol I, Pol II, Pol IV, i Pol V). Kao primarni holoenzim procesa replikacije, DNK Pol III holoenzim takođe poseduje sposobnost korekture kojom se ispravljaju replikacione greške u 3'->5' smeru posredstvom dejstva egzonuklease. DNK Pol III je komponenta replizoma, koji je lociran na replikacionoj račvi.[1][2]

Komponente[уреди]

DNK polimeraza III, delta podjedinica
PDB 1xxh EBI.jpg
atpgs vezan za e. coli kompleks vodiča klampe
Identifikatori
SimbolDNA_pol3_delta
PfamPF06144
Pfam klanCL0023
InterProIPR010372
SCOP1jql
SUPERFAMILY1jql
DNK polimeraza III, delta podjedinica, C terminal
PDB 1xxi EBI.jpg
adp vezan za e. coli kompleks vodiča klampe
Identifikatori
SimbolDNApol3-delta_C
PfamPF09115
InterProIPR015199
SCOP1a5t
SUPERFAMILY1a5t
Bakterijska DNK polimeraza III, alfa podjedinica
Identifikatori
SimbolDNA_pol3_alpha
PfamPF07733
InterProIPR011708
DNA polimeraza III, podjedinica tau, domen IV
Identifikatori
SimbolDNA_pol3_tau_4
PfamPF12168
InterProIPR022001
DNK polimeraza III, teta podjedinica
PDB 2ido EBI.jpg
Struktura e. coli Pol III epsilon-hot korekcioni kompleks
Identifikatori
SimbolDNA_pol3_theta
PfamPF06440
InterProIPR009052
SCOP1du2
SUPERFAMILY1du2
DNK polimeraza III, či podjedinica, HolC
PDB 1em8 EBI.jpg
Kristalna struktura či i psi podjedinice heterodimera DNK Pol III
Identifikatori
SimbolDNA_pol3_chi
PfamPF04364
InterProIPR007459
SCOP1em8
SUPERFAMILY1em8
DNK polimeraza III, tau podjedinica V u interakciji sa alfa
Identifikatori
SimbolDNA_pol3_tau_5
PfamPF12170
InterProIPR021029

Replizom se sastoji od sledećeg:

  • 2 DNK Pol III enzima, svaki od njih sadrži α, ε and θ podjedinice.
    • α podjedinica ima polimeraznu aktivnost.
    • ε podjedinica ima 3'-5' egzonukleaznu aktivnost.
    • θ podjedinica stimuliše korekturu ε podjecinice.
  • 2 β jedinice omogučavaju pomeranje DNK klamfe
  • 2 τ jedinice dimerizuju dva sržna enzima (α, ε, i θ podjedinice).
  • 1 γ jedinica pomaže β podjedinicama pri vezivanju za DNK.
  • Χ i Ψ formiraju 1:1 kompleks i vezuju se za γ ili τ.[1]

Reference[уреди]

  1. 1,0 1,1 Olson, M. W.; Dallmann, H. G.; McHenry, C. S. (1995). „DnaX complex of Escherichia coli DNA polymerase III holoenzyme. The chi psi complex functions by increasing the affinity of tau and gamma for delta.delta' to a physiologically relevant range”. The Journal of Biological Chemistry. 270 (49): 29570—29577. PMID 7494000. 
  2. ^ Kelman, Z.; O'Donnell, M. (1995). „Dna Polymerase III Holoenzyme: Structure and Function of a Chromosomal Replicating Machine”. Annual Review of Biochemistry. 64: 171. doi:10.1146/annurev.bi.64.070195.001131. 

Literatura[уреди]

Spoljašnje veze[уреди]