Endonukleaza specifična za strukturu prepusta 1

Из Википедије, слободне енциклопедије
FEN1
Protein FEN1 PDB 1ul1.png
Available structures
PDB Ortholog search: PDBe RCSB
Identifikatori
Alijasi FEN1, Flap endonuclease 1, flap structure-specific endonuclease 1, FEN-1, MF1, RAD2
Spoljašnji ID MGI: 102779 HomoloGene: 3034 GeneCards: 2237
Pregled RNK izražavanja
PBB GE FEN1 204768 s at fs.png

PBB GE FEN1 204767 s at fs.png
Dodatne reference o podacima o izražavanju
Ortolozi
Vrsta Čovek Miš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNA)

NM_004111

NM_001271614
NM_001271615
NM_007999

RefSeq (protein)

NP_004102

n/a

Lokacija (UCSC) Chr 11: 61.79 – 61.8 Mb n/a
PubMed pretraga [1] [2]
Wikidata
View/Edit Human View/Edit Mouse

Flap endonukleaza 1 je enzim koji je kod ljudi kodiran FEN1 genom.[3][4]

Protein kodiran ovim genom uklanja 5' prepuste tokom DNK popravke i obrađuje 5' krajeve Okazakijevih fragmenta pri sintezi zaostajućeg lanca DNK. Direktna fizička interakcija između tog proteina i AP endonukleaze 1 tokom popravke isecanjem dugog segmenta baza omogućava koordinirani pristup proteina supstratu, čime se supstrat dodaje od jednog enzima do drugog. Ovaj protein je član XPG/RAD2 familije endonukleaza i jedan je od deset proteina koji su esencijalni za bezćelijsku replikaciju DNK. Sekundarna struktura DNK može da inhibira flap obradu na pojedinim trinukleotidnim ponavljanjima u maniru zavisnom od dužine koji skrivaju 5' kraj prepusta, koji je neophodan za vezivanje i presecanje proteinom kodiranim ovim genom. Stoga sekundarna struktura može da onemogući protektivnu funkciju ovog proteina, što dovodi do trinukleotidnih ekspanzija specifičnih za mesto.[4]

Interakcije[уреди]

Endonukleaza 1 specifična za flap strukturu formia interakcije:

Reference[уреди]

  1. „Human PubMed Reference:”. 
  2. „Mouse PubMed Reference:”. 
  3. Hiraoka LR, Harrington JJ, Gerhard DS, Lieber MR, Hsieh CL (1995). „Sequence of human FEN-1, a structure-specific endonuclease, and chromosomal localization of the gene (FEN1) in mouse and human”. Genomics. 25 (1): 220—5. PMID 7774922. doi:10.1016/0888-7543(95)80129-A. 
  4. 4,0 4,1 „Entrez Gene: FEN1 flap structure-specific endonuclease 1”. 
  5. 5,0 5,1 Dianova II, Bohr VA, Dianov GL (2001). „Interaction of human AP endonuclease 1 with flap endonuclease 1 and proliferating cell nuclear antigen involved in long-patch base excision repair”. Biochemistry. 40 (42): 12639—44. PMID 11601988. doi:10.1021/bi011117i. 
  6. 6,0 6,1 Sharma S, Sommers JA, Wu L, Bohr VA, Hickson ID, Brosh RM (2004). „Stimulation of flap endonuclease-1 by the Bloom's syndrome protein”. J. Biol. Chem. 279 (11): 9847—56. PMID 14688284. doi:10.1074/jbc.M309898200. 
  7. 7,0 7,1 7,2 Henneke G, Koundrioukoff S, Hübscher U (2003). „Phosphorylation of human Fen1 by cyclin-dependent kinase modulates its role in replication fork regulation”. Oncogene. 22 (28): 4301—13. PMID 12853968. doi:10.1038/sj.onc.1206606. 
  8. 8,0 8,1 Hasan S, Stucki M, Hassa PO, Imhof R, Gehrig P, Hunziker P, Hübscher U, Hottiger MO (2001). „Regulation of human flap endonuclease-1 activity by acetylation through the transcriptional coactivator p300”. Mol. Cell. 7 (6): 1221—31. PMID 11430825. doi:10.1016/s1097-2765(01)00272-6. 
  9. Chai Q, Zheng L, Zhou M, Turchi JJ, Shen B (2003). „Interaction and stimulation of human FEN-1 nuclease activities by heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1 in alpha-segment processing during Okazaki fragment maturation”. Biochemistry. 42 (51): 15045—52. PMID 14690413. doi:10.1021/bi035364t. 
  10. Jónsson ZO, Hindges R, Hübscher U (1998). „Regulation of DNA replication and repair proteins through interaction with the front side of proliferating cell nuclear antigen”. EMBO J. 17 (8): 2412—25. PMC 1170584Слободан приступ. PMID 9545252. doi:10.1093/emboj/17.8.2412. 
  11. Gary R, Ludwig DL, Cornelius HL, MacInnes MA, Park MS (1997). „The DNA repair endonuclease XPG binds to proliferating cell nuclear antigen (PCNA) and shares sequence elements with the PCNA-binding regions of FEN-1 and cyclin-dependent kinase inhibitor p21”. J. Biol. Chem. 272 (39): 24522—9. PMID 9305916. doi:10.1074/jbc.272.39.24522. 
  12. Chen U, Chen S, Saha P, Dutta A (1996). „p21Cip1/Waf1 disrupts the recruitment of human Fen1 by proliferating-cell nuclear antigen into the DNA replication complex”. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 93 (21): 11597—602. PMC 38103Слободан приступ. PMID 8876181. doi:10.1073/pnas.93.21.11597. 
  13. Yu P, Huang B, Shen M, Lau C, Chan E, Michel J, Xiong Y, Payan DG, Luo Y (2001). „p15(PAF), a novel PCNA associated factor with increased expression in tumor tissues”. Oncogene. 20 (4): 484—9. PMID 11313979. doi:10.1038/sj.onc.1204113. 
  14. Brosh RM, von Kobbe C, Sommers JA, Karmakar P, Opresko PL, Piotrowski J, Dianova I, Dianov GL, Bohr VA (2001). „Werner syndrome protein interacts with human flap endonuclease 1 and stimulates its cleavage activity”. EMBO J. 20 (20): 5791—801. PMC 125684Слободан приступ. PMID 11598021. doi:10.1093/emboj/20.20.5791. 

Literatura[уреди]