Цинков прст
Цинкови прсти су мали протеински структурни мотиви који могу да формирају координатне везе са једним или више јона цинка чиме се стабилизује њихова структура. Они се могу класификовати у неколико различитих структурних фамилија (протеина цинковог прста). Цинкови прсти типично функционишу као модули који формирају интеракције са ДНК, РНК, протеинима, или малим молекулима. Име „цинков прст“ је оригинално означавало прсту сличне појаве на дијаграмима који су приказивали хипотетичне структуре понављајућих јединица Xenopus laevis транскрипционог фактора GTF3A.[1]
Класе[уреди | уреди извор]
Цинкови прсти су координатни комплекси јона цинка и аминокиселинских остатака цистеина и хистидина. Они се могу класификовати по типу и реду остатака који координирају цинк (е.г., Cys2His2, Cys4, и Cys6). Систематичнији метод је класификација у различите групе савијања на основу свеукупног облика њихове протеинске основе. Најчешће групе савијања цинкових прстију су Cys2His2-слични („класични цинков прст“), троструки кључ, и цинкова трака.[2]
Следећа табела[2] показује различите структуре и њихове кључне особине:
| Група | Пример структуре | Пласман лиганда |
|---|---|---|
| Cys2His2 |  |
Два лиганда формирају зглавак и два додатна формирају C терминус хеликса. |
| Гаг зглавак |  |
Два лиганда формирају зглавак и два додатна формирају кратки хеликс или петљу. |
| Троструки кључ | Два лиганда формирају зглавак и два додатна формирају N терминус хеликса. | |
| Цинкова трака |  |
Два лиганда формирају два зглавка. |
| Zn2/Cys6 |  |
Два лиганда формирају N терминус хеликса и два додатна формирају петљу. |
| TAZ2 домену сличан | Два лиганда формирају терминусе два хеликса. |
Референце[уреди | уреди извор]
- ^ Миллер Ј, МцЛацхлан АД, Клуг А (1985). „Репетитиве зинц-биндинг домаинс ин тхе протеин трансцриптион фацтор ИИИА фром Xенопус ооцyтес”. ЕМБО Ј. 4 (6): 1609—14. ПМЦ 554390
. ПМИД 4040853.
- ^ а б Крисхна СС, Мајумдар I, Грисхин НВ (2003). „Струцтурал цлассифицатион оф зинц фингерс: сурвеy анд суммарy”. Нуцлеиц Ацидс Рес. 31 (2): 532—50. ПМЦ 140525 . ПМИД 12527760. дои:10.1093/нар/гкг161.
Види још[уреди | уреди извор]
Спољашње везе[уреди | уреди извор]
- МцДоwалл Ј. „Протеин оф тхе Монтх: Зинц Фингерс”. Еуропеан Молецулар Биологy Лабораторy - Еуропеан Биоинформатицс Институте (ЕМБЛ-ЕБИ). Приступљено 13. 01. 2008.
- Гоодселл ДС. „Молецуле оф тхе Монтх: Зинц Фингерс”. Ресеарцх Цоллабораторy фор Струцтурал Биоинформатицс (РЦСБ) Протеин Дата Банк (ПДБ). Архивирано из оригинала 31. 05. 2008. г. Приступљено 13. 01. 2008.