УЕФА Лига Европе 2012/13. је 42 сезона одржавања другог европског фудбалског такмичења у организацију УЕФА а четврта сезона од када је преименовано из Купа УЕФА у УЕФА Лигу Европе.
Систем такмичења ће имати две измене у односу на систем по којем се играла УЕФА лиге Европе 2011/12.
— Освајачи купа у 6 најбоље пласираних фудбалских савеза директно ће се укључити у групну фазу такмичења[2]. Ова измена има директан утицај на квалификациони део Лиге Европе, јер се због прилагођавања морају правити нове листе.[3]
— Утакмице 5 и 6 кола групне фазе неће се као раније играти у различитим недељама у односу на утакмице Лиге шампиона, него ће се играти исте недеље.
У УЕФА лиги Европе 2012/13. учествовала су 193 представника 53 национална савеза УЕФА. Број екипа из појединог савеза одређује се према УЕФА лига коефицијенту за 2011 годину, који узима у обзир њихов успех у европским такмичењима од 2006/07 до 20010/11.[4]
Савези рангирани од 1 до 6 ће имати по 3 клуба у квалификацијама
Савези рангирани од 7 до 9 ће имати по 4 клуба у квалификацијама
Савези рангирани од 10 до 51 ће имати по 3 клуба (осим Лихтенштајна који ће имати 1 клуб јер нема национално првенство))
Савези рангирани од 52 до 53 ће имати по 2 клуба
3 екипе победнице у Фер-плеју у сезони 2011/12.
32 екипе елиминисане из Лиге шампиона 2011/12 прелазе УЕФА лигу Европе (овде је једна мање него обично јер Тотенхем неће учествовати у квалификацијама јер је према правилима УЕФЕ морао уступити своје место победнику Лиге шампиона 2011/12.Челсију који се према пласману у националном првенству није пласирао за то такмичење).
Чешка Република (ЧЕШ): Сигма Оломоуц, освајач Купа Чешке Републике 2011/12., је првобитно требало да такмичење у Лиги Европе почне од трећег кола квалификација. Међутим, УЕФА им је забранила да учествују у Лиги Европе због умешаности клуба у корупцијски скандал.[10] Као резултат тога, Спарта Праг, другопласирана екипа Прве лиге Чешке 2011/12., ће такмичење у Лиги Европе почети у трећем уместо у другом колу, а Млада Болеслав, четвртопласирана екипа у лиги, ће попунити место Чешке Републике у другом колу квалификација.
Енглеска (ЕНГ): Челси, победник УЕФА Лиге шампиона 2011/12, завршио је Премијер лигу 2011/12. на шестом месту, али због ограничења којим савез не може послати више од 4 клуба у Лиги шампиона, Челси је свој улазак у овогодишње такмичење добио на уштрб Тотенхем хотспера који је на крају првенства заузимао четврто место и који ће играти у УЕФА лиги Европе.
Грчка (ГРЧ): АЕК Атина, трећепласирана екипа Суперлиге Грчке 2011/12., због финансијских проблема није могла да добије УЕФА лиценцу за такмичење у Лиги Европе.[11] Као резултат тога, Атромитос и ПАОК, четвртопласирана и петопласирана екипа у лиги, ће такмичење у Лиги Европе почети из плеј офа и трећег кола квалификација уместо трећег и другог кола квалификација према наведеном реду, а Астерас Триполи, шестопласирани у лиги, ће попунити место Грчке у другом колу квалификација.
Мађарска (МАЂ): Ђер, који је завршио као трећепласирани у Првој лиги Мађарске 2011/12., не може да учествује у Лиги Европе 2012/13. јер је клуб дисквалификован из учешћа у УЕФА такмичењима на три сезоне, од сезоне 2011/12. до 2013/14., због кршења правила око лиценцирања клуба.[12] Као резултат тога, Хонвед, четвртопласирани у лиги, ће попунити место Мађарске у првом колу квалификација.
Република Ирска (ИРС): Дери сити, трећепласирани у Првој лиги Ирске 2011, је отишао у ликвидацију пре две године, што је довело да забране учешћа у европским такмичењима на три године.[13]Бохимијан, петопласирана екипа у лиги, је попунила место у првом колу квалификација Лиге Европе.
Шкотска (ШКО): Упркос томе што је завршио сезону као други у Премијер лиги Шкотске 2011/12., Ренџерс не може да учествује у европским такмичењима јер није успео да изађе из администрације на време да би добио УЕФА лиценцу.[14] Као резултат тога, Мадервел, трећепласирани у лиги, ће попунити место Шкотске у квалификацијама за Лигу шампиона уместо учешћа у трећем колу квалификација Лиге Европе, а самим тим и, Данди јунајтед, четвртопласирани у лиги, ће у Лиги Европе кренути од трећег уместо другог кола квалификација, а Сент Џонстон, шестопласирани у лиги, ће попунити место Шкотске у другом колу квалификација (пошто је петопласирани Хартс већ обезбедио учешће у Лиги Европе као освајач Купа Шкотске 2011/12).
Турска (ТУР): Бешикташу, четвртопласираном у Суперлиги Турске 2011/12., због финансијских проблема УЕФА је забранила учешће у Лиги Европе 2012/13.[15] Као резултат тога, Бурсаспор, петопласирани у лиги, ће такмичење у Лиги Европе почети од трећег уместо другог кола квалификација, а Ескишехирспор, шестопласирани у лиги, ће попунити место Турске у другом колу квалификација. Бурсаспору је такође првобитно било забрањено учешће у Лиги Европе, али ту одлуку је поништио Арбитражни суд за спорт.[16]
Напомена 3: УЕФА је доделила Мури 05 победу од 3:0, јер је Арсенал Кијев у првом мечу у тиму имао суспендованог играча Ерика Матукуа. Та утакмица је иначе завршена победом Арсенала Кијев од 3:0.
Напомена 4: Редослед домаћинства промењен после извлачења жреба.
Напомена 5: Утакмица је прекинута у 82. минуту због нереда навијача Анортозиса. Дила Гори је у тренутку прекида утакмице водила са 3:0, а тај резултат је на крају и УЕФА потврдила.
Жреб за такмичење по групама је одржан 31. августа2012. у Монаку.[19] 48 тимова су подељена у четири шешира на основу њиховог УЕФА клупског коефицијента из 2012, са тиме што је бранилац титуле Атлетико Мадрид аутоматски распоређен у шешир 1. Подељени су у дванаест група са по четири тима, уз ограничење да клубови из истог националног савеза не могу бити постављени у истој групи.
Легенда:
Победник групе и другопласирани пролазе у шеснаестину финала.
^„UEFA sperrt Sigma Olomouc”. Financial Times Deutschland (на језику: немачком). 20. 6. 2012. Архивирано из оригинала 02. 08. 2012. г. Приступљено 03. 07. 2012.CS1 одржавање: Непрепознат језик (веза)